More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0404 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  48.88 
 
 
1248 aa  654  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  62.82 
 
 
704 aa  642  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  100 
 
 
1182 aa  2441  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  50.87 
 
 
918 aa  476  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  48.19 
 
 
754 aa  459  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  57.11 
 
 
657 aa  454  1e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  52.7 
 
 
800 aa  439  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  38.68 
 
 
945 aa  407  1e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  37.94 
 
 
886 aa  400  1e-110  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  50.23 
 
 
936 aa  402  1e-110  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  34.21 
 
 
819 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  32.2 
 
 
1210 aa  345  3e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
3706 aa  340  1e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  35.8 
 
 
1289 aa  325  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  31.5 
 
 
1047 aa  318  5e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  44.94 
 
 
676 aa  314  7e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  38.24 
 
 
746 aa  312  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
980 aa  300  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
1676 aa  292  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
2072 aa  290  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
1758 aa  290  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  31.91 
 
 
892 aa  266  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
1093 aa  264  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
1093 aa  263  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  36.4 
 
 
492 aa  257  1e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  47.06 
 
 
449 aa  254  9e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
547 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.36 
 
 
1341 aa  245  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  70.18 
 
 
1019 aa  245  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  51.89 
 
 
1265 aa  244  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  33.95 
 
 
1202 aa  244  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.92 
 
 
1047 aa  243  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  45.78 
 
 
682 aa  242  3e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
721 aa  241  7e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.4 
 
 
1047 aa  241  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
771 aa  238  5e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
1255 aa  236  2e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
1253 aa  235  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
1390 aa  235  4e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 
834 aa  234  7e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 
1055 aa  231  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
1246 aa  225  5e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
2693 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 
1501 aa  220  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
1714 aa  216  1e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.95 
 
 
828 aa  214  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
613 aa  214  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 
727 aa  213  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
1177 aa  211  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34 
 
 
783 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  42.37 
 
 
969 aa  209  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  48.25 
 
 
991 aa  209  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
1273 aa  207  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
945 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
789 aa  206  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.54 
 
 
744 aa  206  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
717 aa  204  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
462 aa  203  1e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
1432 aa  203  2e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
862 aa  202  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
1015 aa  201  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
572 aa  201  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
551 aa  197  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
964 aa  196  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 
1654 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.14 
 
 
1032 aa  194  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 
1342 aa  193  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
1297 aa  192  3e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 
814 aa  191  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
1669 aa  190  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
932 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
1051 aa  186  2e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 
1965 aa  186  2e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.77 
 
 
683 aa  186  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
788 aa  185  4e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
987 aa  184  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  38.64 
 
 
1081 aa  184  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  28.05 
 
 
1239 aa  183  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 
767 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
815 aa  181  6e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.91031e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
488 aa  181  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3508  putative PAS/PAC sensor protein  58.49 
 
 
554 aa  181  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.254838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
759 aa  181  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1011 aa  178  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
764 aa  177  1e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3647  hypothetical protein  41.1 
 
 
305 aa  175  4e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
1051 aa  175  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
1059 aa  175  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.66 
 
 
1131 aa  173  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.27 
 
 
1057 aa  173  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.62 
 
 
960 aa  172  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.47 
 
 
1418 aa  171  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  49.17 
 
 
935 aa  172  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
681 aa  171  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
631 aa  171  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
723 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.32 
 
 
922 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.56 
 
 
1344 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  28.01 
 
 
1561 aa  169  3e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
1259 aa  169  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>