More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0372 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  100 
 
 
1085 aa  2229    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  31.44 
 
 
477 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  32.92 
 
 
436 aa  122  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  30.74 
 
 
442 aa  112  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  37.43 
 
 
376 aa  111  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 
396 aa  105  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
442 aa  105  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  33.88 
 
 
646 aa  101  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  33.52 
 
 
373 aa  98.6  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  29.47 
 
 
1635 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  25.87 
 
 
351 aa  92.4  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  29.82 
 
 
306 aa  89.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
272 aa  87.4  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  33.33 
 
 
272 aa  87.4  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  30.11 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  31.65 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  30.83 
 
 
231 aa  67.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
995 aa  65.9  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.32 
 
 
391 aa  64.7  0.000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  27.08 
 
 
383 aa  64.3  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  31.09 
 
 
185 aa  63.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  38.24 
 
 
247 aa  62.4  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.14 
 
 
243 aa  60.8  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.72 
 
 
345 aa  61.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.14 
 
 
234 aa  60.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.97 
 
 
260 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  36.36 
 
 
220 aa  59.7  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
286 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  28.47 
 
 
2112 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  33.64 
 
 
194 aa  58.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35 
 
 
270 aa  58.2  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  35.63 
 
 
214 aa  58.2  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
332 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  34.88 
 
 
201 aa  57.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  26.92 
 
 
264 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
235 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  36.67 
 
 
262 aa  57  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  31.46 
 
 
231 aa  57  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  32.43 
 
 
230 aa  57  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.58 
 
 
257 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.66 
 
 
229 aa  56.2  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
277 aa  56.2  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.19 
 
 
230 aa  55.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1966  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
264 aa  55.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 
203 aa  55.8  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.97 
 
 
229 aa  55.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  35.21 
 
 
222 aa  55.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1727  methionine biosynthesis protein MetW  37.33 
 
 
197 aa  56.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.46 
 
 
239 aa  55.5  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  33.71 
 
 
222 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  31.08 
 
 
231 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1647  type 11 methyltransferase  31.15 
 
 
239 aa  55.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.69 
 
 
241 aa  55.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
268 aa  55.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  35.14 
 
 
229 aa  55.1  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  36 
 
 
197 aa  55.1  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  28.68 
 
 
281 aa  54.7  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  28.81 
 
 
358 aa  54.7  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.65 
 
 
246 aa  54.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  29.92 
 
 
244 aa  53.9  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.38 
 
 
229 aa  54.3  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
239 aa  54.3  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.65 
 
 
242 aa  54.3  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.65 
 
 
242 aa  54.3  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.65 
 
 
242 aa  54.3  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  28.67 
 
 
305 aa  54.3  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.65 
 
 
242 aa  53.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.06 
 
 
234 aa  53.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.67 
 
 
241 aa  53.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  32.67 
 
 
242 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.65 
 
 
242 aa  53.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.65 
 
 
242 aa  53.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.65 
 
 
242 aa  53.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 
253 aa  53.5  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.65 
 
 
242 aa  53.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.33 
 
 
266 aa  53.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  32.47 
 
 
204 aa  53.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
259 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.25 
 
 
261 aa  52.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 
241 aa  53.1  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 
240 aa  52.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  36.11 
 
 
215 aa  52.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.73 
 
 
237 aa  52.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.73 
 
 
237 aa  52.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.2 
 
 
242 aa  52.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.41 
 
 
232 aa  52.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.62 
 
 
232 aa  52.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.69 
 
 
235 aa  52.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.37 
 
 
233 aa  52.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.16 
 
 
245 aa  52.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  29.84 
 
 
229 aa  52.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  32.08 
 
 
390 aa  52.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 
230 aa  52.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  27.68 
 
 
241 aa  52.4  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1831  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.57 
 
 
370 aa  52.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  28.57 
 
 
250 aa  52.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.97 
 
 
232 aa  52  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  31.65 
 
 
220 aa  52  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  31.68 
 
 
229 aa  52  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  31.68 
 
 
229 aa  52  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>