More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0360 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  100 
 
 		 1074 aa  2145    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  52.59 
 
 		 888 aa  364  5.0000000000000005e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  47.45 
 
 		 891 aa  240  8e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  37.82 
 
 		 924 aa  232  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  53.3 
 
 		 902 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  38.9 
 
 		 895 aa  223  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  47.3 
 
 		 890 aa  221  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  27.39 
 
 		 926 aa  168  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  31.72 
 
 		 993 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  27.87 
 
 		 993 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  29.15 
 
 		 993 aa  104  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  30.7 
 
 		 994 aa  103  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  32.42 
 
 		 1019 aa  96.3  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  32.82 
 
 		 789 aa  85.1  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  25.54 
 
 		 702 aa  84.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 		 702 aa  80.5  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  29.56 
 
 		 1003 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 		 858 aa  79.7  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  25.87 
 
 		 891 aa  78.6  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  28.21 
 
 		 1008 aa  75.1  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  28.74 
 
 		 852 aa  73.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  30.43 
 
 		 702 aa  73.9  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  28.74 
 
 		 852 aa  73.9  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.2 
 
 		 804 aa  72.8  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  26.98 
 
 		 1007 aa  72.8  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  27.65 
 
 		 1057 aa  71.6  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  26.54 
 
 		 1061 aa  71.6  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  28.72 
 
 		 1022 aa  71.2  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  30 
 
 		 851 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  30.16 
 
 		 859 aa  69.3  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  27.68 
 
 		 864 aa  69.3  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  25 
 
 		 955 aa  69.3  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  25.89 
 
 		 824 aa  69.3  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  27.41 
 
 		 1016 aa  68.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  27.85 
 
 		 1008 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  29.15 
 
 		 1022 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  28.04 
 
 		 859 aa  67.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  22.68 
 
 		 984 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  35.34 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  29.7 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0745  chromosome segregation protein SMC  29.57 
 
 		 1150 aa  65.5  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.525394  normal  0.893736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  31.09 
 
 		 1196 aa  65.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  27.72 
 
 		 1019 aa  65.1  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  26.32 
 
 		 812 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  25.41 
 
 		 802 aa  64.3  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  29.76 
 
 		 1176 aa  64.3  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  26.13 
 
 		 1175 aa  63.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  25.82 
 
 		 1042 aa  63.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  26.98 
 
 		 1023 aa  63.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  30.13 
 
 		 1185 aa  63.5  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  39.24 
 
 		 987 aa  62.4  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25 
 
 		 961 aa  61.6  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.38 
 
 		 1174 aa  61.6  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  27.32 
 
 		 693 aa  60.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  33.02 
 
 		 987 aa  61.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  26.62 
 
 		 1154 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  27.81 
 
 		 1184 aa  60.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  24.32 
 
 		 1011 aa  60.1  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.65 
 
 		 1187 aa  60.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  25.23 
 
 		 1047 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  28.41 
 
 		 1151 aa  60.1  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  27.17 
 
 		 1081 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  24.73 
 
 		 1048 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  24.73 
 
 		 1048 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  24.73 
 
 		 1047 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1048 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  37.93 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  28.49 
 
 		 1195 aa  59.7  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  24.73 
 
 		 1047 aa  59.7  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  24.73 
 
 		 1047 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  24.73 
 
 		 1047 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  29.57 
 
 		 1185 aa  59.7  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  24.73 
 
 		 1047 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  26.89 
 
 		 1176 aa  59.3  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  41.38 
 
 		 813 aa  58.9  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  27.78 
 
 		 1031 aa  58.9  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  27.75 
 
 		 1191 aa  58.5  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  24.74 
 
 		 1038 aa  58.5  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  25.77 
 
 		 824 aa  58.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  27.93 
 
 		 1222 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  47.27 
 
 		 514 aa  57.4  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.41 
 
 		 906 aa  57.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  32.93 
 
 		 1188 aa  57.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  23.63 
 
 		 1046 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  32.93 
 
 		 1188 aa  57.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  29.74 
 
 		 784 aa  56.6  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.95 
 
 		 1184 aa  56.6  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  21.71 
 
 		 1168 aa  57  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  28.05 
 
 		 1168 aa  56.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  32.89 
 
 		 814 aa  56.2  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1170 aa  56.2  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1170 aa  56.2  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  28.99 
 
 		 1153 aa  56.2  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  26.78 
 
 		 950 aa  56.2  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  27.72 
 
 		 1151 aa  55.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  30.94 
 
 		 1151 aa  55.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  28 
 
 		 1148 aa  55.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  47.17 
 
 		 421 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  33.33 
 
 		 371 aa  55.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  26.49 
 
 		 1198 aa  55.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>