More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0351 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  100 
 
 		 436 aa  894    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  61.08 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  46.95 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  46.29 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  46.4 
 
 		 439 aa  360  4e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  47.04 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3318  GTP-binding proten HflX  46.48 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0425639  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  40.22 
 
 		 424 aa  229  5e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  38.1 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  37.5 
 
 		 385 aa  216  8e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  37.85 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  37.12 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  39.52 
 
 		 372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  37.44 
 
 		 489 aa  213  7e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  37.82 
 
 		 403 aa  212  9e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  41.18 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  41.18 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  37.16 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  41.18 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  37.41 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  37.34 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  37.8 
 
 		 487 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  37.22 
 
 		 432 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  38.5 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  38.99 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  38.86 
 
 		 454 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  37.84 
 
 		 433 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  38.19 
 
 		 414 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  40.64 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  38.99 
 
 		 429 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  37.96 
 
 		 503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  37.41 
 
 		 435 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0524  GTP-binding protein, HSR1-like  38.75 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227372  normal  0.479047 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  39.22 
 
 		 426 aa  200  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  35.82 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  39.5 
 
 		 426 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  39.5 
 
 		 426 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  39.5 
 
 		 426 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  39.5 
 
 		 426 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  39.5 
 
 		 426 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  38.32 
 
 		 371 aa  199  7e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  38.89 
 
 		 454 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  37.59 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  36.92 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  42.09 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  42.09 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  39.34 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  36.67 
 
 		 481 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  39.17 
 
 		 421 aa  196  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  38.14 
 
 		 420 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  38.94 
 
 		 426 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  38.94 
 
 		 426 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  38.94 
 
 		 426 aa  196  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  38.94 
 
 		 426 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  38.94 
 
 		 426 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  38.94 
 
 		 426 aa  196  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  38.94 
 
 		 426 aa  196  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  38.94 
 
 		 426 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  41.19 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  41.19 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  36.73 
 
 		 437 aa  196  9e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  40.92 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  38.81 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  37.37 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  37.89 
 
 		 582 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  40.92 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  38.76 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  37.84 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  41.41 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  37.97 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07550  GTP-binding protein HflX  41.73 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  38.32 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  38.16 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  37.93 
 
 		 502 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  37.75 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  35.06 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  38.4 
 
 		 433 aa  193  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  36.56 
 
 		 435 aa  192  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  38.32 
 
 		 426 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  37.43 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  37.43 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  33.56 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  37.73 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  38.53 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  35.96 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  39.2 
 
 		 509 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  38.83 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  38.32 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  40.75 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  40.38 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4941  GTP-binding protein HflX  40.05 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  35.7 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0573  GTP-binding protein, HSR1-related  40.05 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  39.05 
 
 		 433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  36.64 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  38.08 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  38.11 
 
 		 596 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  37.87 
 
 		 426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  39.88 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  39.72 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>