19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0337 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0337  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  241  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1487  gas vesicle K  58.59 
 
 
105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.48089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0072  gas vesicle K  55 
 
 
104 aa  108  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  53.12 
 
 
96 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3024  hypothetical protein  57 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524759  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0340  Gas vesicle K  42.53 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2368  Gas vesicle K  42.39 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  42.03 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  42.03 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  42.03 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  44.93 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  44.44 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  38.24 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6862  hypothetical protein  39.06 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3389  gas vesicle K  40.62 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  38.46 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  33.82 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0074  gas vesicle protein GVPa  41.07 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>