146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0270 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  766    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  59.09 
 
 
379 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  59.89 
 
 
379 aa  456  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  40.36 
 
 
398 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  39.01 
 
 
382 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  38.7 
 
 
377 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  38.03 
 
 
451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  38.38 
 
 
383 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  37.24 
 
 
376 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  38.02 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  37.53 
 
 
375 aa  239  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  37.93 
 
 
379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  36.53 
 
 
392 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  35.75 
 
 
375 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  37.36 
 
 
376 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  36.6 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  34.82 
 
 
376 aa  219  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  34.88 
 
 
384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  35.64 
 
 
385 aa  212  9e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  35.7 
 
 
378 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  32.03 
 
 
398 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  35.96 
 
 
378 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  35.06 
 
 
382 aa  206  7e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  34.66 
 
 
378 aa  203  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  33.92 
 
 
396 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  31.14 
 
 
371 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  31.02 
 
 
382 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  34.8 
 
 
323 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  33.7 
 
 
319 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  33.7 
 
 
319 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  35.85 
 
 
323 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  31.58 
 
 
396 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  33.83 
 
 
318 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  31.95 
 
 
315 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  35.57 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  34.43 
 
 
261 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  34.43 
 
 
261 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.85 
 
 
618 aa  135  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  33.61 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  29.92 
 
 
301 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  30.45 
 
 
328 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  28.79 
 
 
316 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  30.31 
 
 
347 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  27.72 
 
 
303 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  29.79 
 
 
331 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  28.91 
 
 
441 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  28.41 
 
 
306 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  30.83 
 
 
332 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  31.7 
 
 
293 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  28.97 
 
 
442 aa  99.8  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  30.89 
 
 
306 aa  99.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  30.19 
 
 
293 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  29.81 
 
 
293 aa  96.3  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  29.5 
 
 
304 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  28.79 
 
 
309 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  29.31 
 
 
282 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  29.39 
 
 
348 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  27.68 
 
 
505 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  27.43 
 
 
375 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  28.67 
 
 
294 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  26.69 
 
 
360 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  28.92 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  25.37 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  25.33 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  28.69 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  38.31 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  38.31 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  27.24 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  26.28 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  24.52 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  34.07 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  39.09 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  28.23 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.32 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  25 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  25.29 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  23.92 
 
 
308 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  27.83 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  25.97 
 
 
479 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  28.74 
 
 
306 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  40.98 
 
 
434 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  26.07 
 
 
301 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1746  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.58 
 
 
126 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117316  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0934  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.34 
 
 
695 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0429  hypothetical protein  31.82 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  23.22 
 
 
306 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0512  hypothetical protein  24.6 
 
 
265 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0639953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.15 
 
 
687 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1283  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.43 
 
 
566 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.15 
 
 
699 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  37.93 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1783  hypothetical protein  25 
 
 
263 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000128994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3796  hypothetical protein  42.62 
 
 
517 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0524079  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3732  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.82 
 
 
743 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.62401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2764  4Fe-4S ferredoxin  33.85 
 
 
726 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  32.79 
 
 
367 aa  47  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1683  hypothetical protein  24.24 
 
 
278 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269459  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4065  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 
713 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.929518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  37.93 
 
 
598 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.85 
 
 
552 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>