157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0249 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  40 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  38.94 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  39.02 
 
 
226 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  38.57 
 
 
209 aa  134  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  40.69 
 
 
227 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  37.44 
 
 
210 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  35.64 
 
 
205 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  36.45 
 
 
226 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  38.92 
 
 
215 aa  118  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  36.06 
 
 
209 aa  118  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  34.45 
 
 
213 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  34.45 
 
 
213 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  34.16 
 
 
205 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  35.1 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  36.06 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  33.33 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  35.1 
 
 
208 aa  111  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  35.1 
 
 
208 aa  111  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  31.22 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  35.41 
 
 
203 aa  108  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  32.68 
 
 
210 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  32.55 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  29.72 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  32.85 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.99 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  34 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  29.27 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  28.78 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  29.27 
 
 
209 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  29.47 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  28.78 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  28.78 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  28.78 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  28.78 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  33.33 
 
 
192 aa  85.1  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  29.13 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  30.67 
 
 
238 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.05 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  31.1 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  27.67 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  27.67 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  28.7 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  28.08 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  28.08 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  28.08 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  28.08 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  28.71 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  28.08 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  28.08 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  28.08 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  27.18 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.61 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  27.18 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  27.18 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  31.22 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  32.24 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  28.08 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  26.7 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  29.85 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  28.08 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  26.83 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  27.05 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  30.33 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  27.98 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  27.59 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  26.21 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  26.09 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  26.54 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  28.92 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  28.99 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  29.19 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.44 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  30.64 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  28.23 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  27.96 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  25.5 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  30.05 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  28.57 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  27.49 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  28.5 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  28.23 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  29.67 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  27.94 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  26.19 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.17 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  28.38 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  28.1 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  28.1 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  27.4 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  28.1 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  28.1 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  26.89 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  27.36 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  25.37 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  29.05 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  28.02 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  27.62 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  25 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>