More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0205 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  100 
 
 		 207 aa  416  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  53.68 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  41 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  35.71 
 
 		 310 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  34.76 
 
 		 273 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  39.01 
 
 		 283 aa  96.3  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  33.87 
 
 		 273 aa  94.7  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  34.95 
 
 		 264 aa  94  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  34.29 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  33.89 
 
 		 190 aa  92.4  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  39.01 
 
 		 273 aa  92  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  32.4 
 
 		 321 aa  89.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  39.44 
 
 		 276 aa  86.3  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  34.62 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  35.51 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  34.57 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  34.53 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  34.53 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  35.66 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  34.42 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  33.76 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  39.09 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  30.27 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  33.79 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  35.77 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1552  Rhomboid family protein  29.44 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  37.32 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  33.82 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  28.06 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  32.26 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  36.17 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  35.67 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  33.13 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  34.64 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  32.73 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  29.15 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  27 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  31.35 
 
 		 315 aa  75.1  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  31.68 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  31.82 
 
 		 261 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  33.09 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  34.56 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  29.69 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  30 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  29.61 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  34.56 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  42.31 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  34.56 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  34.25 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  31.79 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  30.6 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  39.29 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  31.33 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  29.76 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  32.47 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  39.31 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  33.09 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  32.68 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  32.32 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  33.82 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  33.82 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.29 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  33.82 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  33.82 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  33.71 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  35.62 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  35.37 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  29.14 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  34.87 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  30 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  31.79 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  34.81 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  37.96 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  31.82 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  33.15 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  30.73 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  30.73 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  30.73 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  30.73 
 
 		 276 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  30.73 
 
 		 276 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  27.81 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  36.2 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  29.63 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  32.08 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  28.67 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  29.45 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  32.95 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  27.44 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  25.6 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  34.71 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  29.55 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  36.18 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  29.82 
 
 		 259 aa  64.7  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  32.42 
 
 		 275 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  36.04 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  34.53 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  32.17 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  28.85 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  30.66 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>