175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0194 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  79.43 
 
 		 210 aa  348  3e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  60.1 
 
 		 207 aa  258  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  57.89 
 
 		 211 aa  255  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  56.85 
 
 		 213 aa  239  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  60.64 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  56.12 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  55.45 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  51.92 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  50.48 
 
 		 219 aa  221  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  50.48 
 
 		 219 aa  221  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  50 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  49.05 
 
 		 219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  49.74 
 
 		 200 aa  184  6e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  47.85 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  40.59 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  46.6 
 
 		 217 aa  167  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  43.65 
 
 		 200 aa  161  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  44.21 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  44.1 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  44.86 
 
 		 243 aa  157  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  43 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  41.44 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  45.26 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  41.71 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  37.44 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  36.32 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  39.89 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  38.55 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  35.15 
 
 		 283 aa  134  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  36.41 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  33.85 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  36.56 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  33.83 
 
 		 297 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  36.87 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  39.27 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  39.2 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  35.33 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.07 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.07 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  39.08 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  36.19 
 
 		 282 aa  118  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  34.95 
 
 		 259 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  34.41 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  34.41 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  33.95 
 
 		 288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  33.87 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  32.46 
 
 		 282 aa  110  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  33.65 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  33.8 
 
 		 283 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  31.05 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  32.87 
 
 		 290 aa  104  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  32.69 
 
 		 284 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  30.24 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  34.54 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  31.19 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  30.2 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  29.9 
 
 		 271 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  32.23 
 
 		 282 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  31.46 
 
 		 278 aa  98.2  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  30.69 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  30.69 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  29.77 
 
 		 273 aa  96.7  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  30.85 
 
 		 279 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  29.58 
 
 		 304 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  32.88 
 
 		 292 aa  94.7  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  30.54 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  33.51 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  31.94 
 
 		 303 aa  93.6  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  29 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.37 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  31.02 
 
 		 324 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  32.24 
 
 		 280 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  27.09 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  28.57 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  32.21 
 
 		 270 aa  92  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  29.69 
 
 		 217 aa  92  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  33.01 
 
 		 302 aa  91.7  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  33.52 
 
 		 273 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  31.22 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  32.77 
 
 		 276 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  32.4 
 
 		 273 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  31.68 
 
 		 279 aa  89  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  29.06 
 
 		 267 aa  89  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  28.37 
 
 		 274 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  29.63 
 
 		 272 aa  88.2  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  27 
 
 		 247 aa  88.2  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  28.04 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  27.94 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  33.7 
 
 		 282 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  32.22 
 
 		 285 aa  85.9  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  32.45 
 
 		 306 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  27 
 
 		 268 aa  85.5  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  30.41 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  26.32 
 
 		 245 aa  84.7  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  32.28 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  31.78 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  32.28 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  29.13 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  32.28 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>