More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0169 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
125 aa  254  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  50 
 
 
123 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  52.99 
 
 
120 aa  121  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  44.63 
 
 
121 aa  107  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.46 
 
 
125 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  45.24 
 
 
127 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  45.53 
 
 
121 aa  103  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  44.63 
 
 
125 aa  103  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  43.8 
 
 
121 aa  103  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  44.63 
 
 
121 aa  103  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  46.51 
 
 
126 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  44.88 
 
 
128 aa  101  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  43.2 
 
 
125 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  47.24 
 
 
125 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  44.19 
 
 
126 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  44 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  42.4 
 
 
125 aa  95.9  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  43.2 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.88 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  42.42 
 
 
131 aa  93.6  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  42.97 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.36 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.35 
 
 
112 aa  92  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  42.64 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  41.73 
 
 
124 aa  90.5  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  43.33 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  40.5 
 
 
125 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  40.83 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  41.38 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  38.41 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  42.5 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  44.25 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  42.24 
 
 
112 aa  84  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 
112 aa  83.6  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  42.5 
 
 
112 aa  84  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  37.93 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  40.83 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  40 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  40.83 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  41.38 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  43.97 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  40.83 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  41.38 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  41.38 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  39.66 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  41.38 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  40.17 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  38.79 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  40.83 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  42.24 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1144  nitrogen regulatory protein P-II  38.35 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.931676  normal  0.946017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  43.1 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  42.24 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  40.83 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  43.1 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  43.59 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  43.1 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  38.33 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  38.33 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  43.1 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  41.38 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  42.74 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  41.38 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  41.38 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  40.52 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  43.1 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  40.52 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  41.88 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  40.17 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  39.17 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  41.88 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>