More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0159 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0159  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
114 aa  228  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2347  nitrogen regulatory protein P-II  68.1 
 
 
116 aa  160  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000160523  normal  0.064665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 
112 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 
112 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  52.17 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  49.57 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.75 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  53.51 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0972  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 
113 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1342  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301067  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
136 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  50.88 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.63 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1137  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.201523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.74 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  50 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1302  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54202  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 
112 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 
112 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
116 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
116 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  107  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  49.12 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  107  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
136 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.12 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  41.23 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
117 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.49 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
117 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  105  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>