254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0153 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  632  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  80.5 
 
 		 323 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  52.8 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  55.7 
 
 		 318 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  57.28 
 
 		 317 aa  342  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  50.62 
 
 		 323 aa  339  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  52.53 
 
 		 351 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  50 
 
 		 315 aa  335  9e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  50.63 
 
 		 351 aa  322  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  47.96 
 
 		 352 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  49.37 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  47.78 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  50 
 
 		 315 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  47.47 
 
 		 315 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  49.22 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  47.9 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  47.77 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  48.4 
 
 		 315 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  55.7 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  56.01 
 
 		 318 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  56.01 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  43.41 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  47.62 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  45.08 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  43.95 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  40.94 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  46.01 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  44.76 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  47.3 
 
 		 319 aa  294  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  45.54 
 
 		 319 aa  292  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  46.08 
 
 		 381 aa  292  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  43.17 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  48.42 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  47 
 
 		 334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  46.65 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  43.34 
 
 		 352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  46.86 
 
 		 331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  47.17 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  46.86 
 
 		 331 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  44.41 
 
 		 366 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  44.87 
 
 		 377 aa  281  9e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  41.35 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  44.09 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  44.52 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  46.54 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  44.65 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  41.93 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  41.59 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  46.54 
 
 		 331 aa  279  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  43.85 
 
 		 352 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  45.94 
 
 		 337 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  45.1 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  42.62 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  45.9 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  45.59 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  45.03 
 
 		 351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  44.89 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  43.89 
 
 		 335 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  44.3 
 
 		 348 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  40.73 
 
 		 350 aa  272  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  45.92 
 
 		 351 aa  271  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  45.06 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  43.47 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  46.08 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  45.36 
 
 		 353 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  43.47 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  43.47 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  44.38 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  43.71 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  44.11 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  44.9 
 
 		 349 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  42.02 
 
 		 353 aa  262  6.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  42.76 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  46.77 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  46.89 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  42.55 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  45.37 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  41.1 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  41.4 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  42.55 
 
 		 371 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  42.48 
 
 		 370 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  42.57 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  41.06 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  42.19 
 
 		 337 aa  235  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  41 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  39.6 
 
 		 316 aa  223  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  37.66 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  31.94 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  32.89 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  35.16 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  32.7 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  31.77 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  31.13 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  30.51 
 
 		 293 aa  149  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  29.66 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  26.94 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  30.23 
 
 		 306 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  29.43 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  28.75 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  29.36 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>