123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0108 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 82 aa  168  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  70.73 
 
 		 82 aa  127  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  49.4 
 
 		 83 aa  88.6  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  51.25 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  51.25 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  45.57 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  44.58 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  44.44 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  45.57 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  42.5 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  45.57 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  44.44 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.75 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  38.16 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  36.71 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  38.96 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  37.97 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  38.27 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  34.67 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  44 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  44.29 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  38.67 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  47.54 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  41.33 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  41.33 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  39.19 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  40 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  38.55 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  39.56 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  40 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  51.92 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  35.44 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  38.67 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  35.44 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  39.56 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  35.44 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  49.09 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  37.36 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  43.86 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  39.02 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  49.06 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  38.96 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  38.36 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  40.74 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  40.54 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  49.09 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  49.09 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  49.09 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  38.2 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  41.82 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  41.1 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  39.51 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  49.09 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  43.86 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  43.1 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  43.1 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  44.83 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  43.64 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  38.98 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  37.5 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  36.99 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  38.36 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  34.72 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  36.21 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  38.57 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  37.21 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  41.82 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  35.06 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  36.36 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  38.98 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  32.47 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  37.21 
 
 		 98 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  37.93 
 
 		 103 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  35.71 
 
 		 96 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  37.93 
 
 		 103 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 100 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  37.93 
 
 		 97 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  37.25 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  37.25 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  37.25 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  37.25 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  37.25 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>