124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0105 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 		 151 aa  310  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  69.54 
 
 		 151 aa  226  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  55.19 
 
 		 152 aa  164  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  49.34 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  48.03 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  47.37 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  46.71 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  46.71 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  46.71 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  45.1 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  45.22 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  45.7 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  45.64 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  46 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  46.36 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  47.92 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  45.99 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  41.22 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  36.84 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  44.53 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  38.93 
 
 		 185 aa  110  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  40.69 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  41.22 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  38.51 
 
 		 185 aa  107  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  39.19 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  37.84 
 
 		 185 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  40.38 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.99 
 
 		 183 aa  94.4  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  35.1 
 
 		 184 aa  92.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 127 aa  90.5  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  36.6 
 
 		 185 aa  89.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  35.92 
 
 		 182 aa  84.3  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  30.77 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  29.93 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  29.2 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  29.63 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  29.2 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  25.55 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  29.41 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  30.37 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  34.94 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  31.4 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  27.34 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  39.06 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  27.94 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  29.63 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  27.2 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  33.75 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  25.19 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  27.01 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  31.36 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  29.63 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  25.93 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  25.55 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  27.97 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  26.67 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  25.55 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  28.06 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  29.07 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  26.02 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  28.06 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  26.47 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1941  50S ribosomal protein L22  28.68 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  25.93 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  26.32 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1938  50S ribosomal protein L22  28.68 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2023  50S ribosomal protein L22  28.68 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.734149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  27.54 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  31.25 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23071  50S ribosomal protein L22  34.78 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  31.25 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  26.47 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  25.93 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  25.93 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  26.83 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  25.93 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  25.93 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  25.93 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  25 
 
 		 113 aa  43.9  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  26.83 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  27.21 
 
 		 113 aa  43.9  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1124  50S ribosomal protein L22  25 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1960  50S ribosomal protein L22  34.78 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  26.02 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1760  50S ribosomal protein L22  28.15 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0923883  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19981  50S ribosomal protein L22  25 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.508737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  26.05 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  38.33 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  26.05 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  26.57 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  24.29 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  25.93 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  26.87 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1916  50S ribosomal protein L22  28.46 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  24.44 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  25.93 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>