More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0100 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 		 132 aa  263  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  83.33 
 
 		 132 aa  229  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  68.94 
 
 		 132 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  64.39 
 
 		 132 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  59.85 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  62.12 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  58.33 
 
 		 132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  58.33 
 
 		 132 aa  167  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  59.54 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  58.78 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  58.78 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  57.58 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  58.02 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  58.02 
 
 		 132 aa  159  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 		 132 aa  156  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  57.58 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  53.85 
 
 		 138 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  50.77 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  52.17 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  48.06 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  50 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  48.36 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  48.46 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  48.46 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  47.69 
 
 		 144 aa  120  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  52.99 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  44.62 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.08 
 
 		 140 aa  115  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  45.38 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  44.26 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  43.97 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  40.5 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  40.18 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  46.85 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  40.17 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  45.13 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  41.96 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  41.12 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  44.14 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0686  50S ribosomal protein L14  40.16 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl133  50S ribosomal protein L14  40.98 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  42.06 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  41.67 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  42.34 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  41.96 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  39.67 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  40.74 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  45.1 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  45.05 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  42.06 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  45.1 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  41.18 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  42.45 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  41.12 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  45.05 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  41.88 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  41.38 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  40.74 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  41.03 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  41.67 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  41.67 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  40.74 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  44.14 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  45.05 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  39.81 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  40.74 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  41.38 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  42.16 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  40.74 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  40.74 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  43.52 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  41.38 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  41.67 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1965  50S ribosomal protein L14  42.34 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.555116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  40.17 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  45.05 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23121  50S ribosomal protein L14  41.44 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0991  ribosomal protein L14  40 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  40.74 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  41.67 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  40.17 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  42.06 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0366  50S ribosomal protein L14  42.34 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  40.74 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  39.34 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2413  50S ribosomal protein L14  43.24 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000959501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  40.54 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  38.84 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  41.44 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  41.03 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  39.81 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  41.44 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2392  50S ribosomal protein L14  37.38 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000369599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  40.74 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  42.34 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  40.19 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  41.03 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>