More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0090 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  75.49 
 
 		 211 aa  325  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  72.49 
 
 		 203 aa  298  4e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  65.17 
 
 		 205 aa  276  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  63.37 
 
 		 207 aa  275  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  62.19 
 
 		 205 aa  271  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  64.62 
 
 		 210 aa  270  9e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  62.19 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  61.5 
 
 		 205 aa  267  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  61.69 
 
 		 210 aa  263  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  57.84 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  58.97 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  58.97 
 
 		 229 aa  256  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  58.46 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  57.92 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  58.59 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  58.59 
 
 		 218 aa  244  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  56.37 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  56.92 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  55.15 
 
 		 202 aa  225  4e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  52.55 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  52.58 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  52.58 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  50 
 
 		 205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  50.52 
 
 		 197 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  50 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  49.21 
 
 		 238 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  46.46 
 
 		 214 aa  195  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  46.97 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  47.62 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  45.45 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  44.97 
 
 		 273 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  43.39 
 
 		 259 aa  151  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  40 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  38.18 
 
 		 166 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  39.74 
 
 		 165 aa  104  9e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  38.93 
 
 		 168 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  37.58 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  38.93 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  36.77 
 
 		 172 aa  99  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  37.5 
 
 		 180 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  38.16 
 
 		 165 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  38.16 
 
 		 165 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  38.78 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  39.58 
 
 		 166 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  36.94 
 
 		 169 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  36.91 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  39.58 
 
 		 166 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  36.31 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  38.51 
 
 		 147 aa  95.9  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  35.57 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  39.6 
 
 		 173 aa  95.5  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  38.51 
 
 		 147 aa  95.1  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  38.89 
 
 		 166 aa  95.1  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  36.31 
 
 		 166 aa  94.7  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  39.73 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  36.24 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  36.24 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  36.24 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  36.24 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  36.24 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  36.24 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  36.24 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  36.24 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  36.18 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  36.24 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  36.31 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  35.86 
 
 		 172 aa  94  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  36.6 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  37.18 
 
 		 167 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  40.27 
 
 		 168 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  37.16 
 
 		 173 aa  92.4  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  36.77 
 
 		 182 aa  92.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1973  30S ribosomal protein S5  37.93 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00407796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1216  30S ribosomal protein S5  37.93 
 
 		 186 aa  92  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  39.04 
 
 		 158 aa  92  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  35.71 
 
 		 179 aa  92  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  38 
 
 		 164 aa  92  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  37.58 
 
 		 162 aa  91.7  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1179  30S ribosomal protein S5  37.24 
 
 		 186 aa  91.7  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  36.91 
 
 		 162 aa  91.3  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  34.73 
 
 		 167 aa  91.3  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  41.18 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  37.75 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  41.18 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 163 aa  90.1  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  37.33 
 
 		 167 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  39.24 
 
 		 172 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2312  30S ribosomal protein S5  36.67 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.324963  normal  0.444592 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  35.1 
 
 		 176 aa  89.7  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  37.41 
 
 		 165 aa  89.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  38.62 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  35.71 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  36.71 
 
 		 173 aa  89.4  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  34.19 
 
 		 166 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  38.26 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  37.58 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  33.78 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  38.1 
 
 		 161 aa  88.6  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  36 
 
 		 191 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>