86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0059 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  47.17 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  45.52 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.26 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.82 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.82 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.82 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.52 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.86 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.86 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.86 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  34.36 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.9 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.72 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  32.38 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.67 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.38 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.78 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.37 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.89 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.38 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.87 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.05 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.42 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.05 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.38 
 
 		 253 aa  95.5  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.74 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.82 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  26.17 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.56 
 
 		 290 aa  85.5  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.34 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.73 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  28.24 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.09 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  36.73 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.68 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  27.44 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.28 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  31.85 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.95 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  29.58 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  27.62 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2919  hypothetical protein  41.25 
 
 		 88 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.502344  hitchhiker  0.000212712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  25.23 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.06 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.97 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.82 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.48 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  28.83 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.31 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  28.27 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.56 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.93 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  30.22 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.08 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.6 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  25.11 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.2 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  27.03 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  25.65 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.18 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  27.95 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.06 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.58 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  21.59 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  21.59 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.11 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  21.59 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  22.84 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 		 146 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.51 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  25.12 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1401  hypothetical protein  47.27 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>