42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0053 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  58.02 
 
 
347 aa  432  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  52.76 
 
 
368 aa  420  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  49.57 
 
 
357 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  47.19 
 
 
361 aa  346  4e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3746  hypothetical protein  46.15 
 
 
370 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  43.41 
 
 
379 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  40.62 
 
 
374 aa  280  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  38.99 
 
 
355 aa  272  6e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  39.31 
 
 
355 aa  262  6e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  37.82 
 
 
369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  35.09 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3429  protein of unknown function DUF354  35.14 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0677  protein of unknown function DUF354  36.69 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  36.87 
 
 
344 aa  230  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4579  protein of unknown function DUF354  33.72 
 
 
374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.242869  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0433  protein of unknown function DUF354  33.15 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  32.36 
 
 
369 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3016  protein of unknown function DUF354  31.52 
 
 
367 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  26.32 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  26.57 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  25.96 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  26.48 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  21.84 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  23.17 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  22.89 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  24.58 
 
 
342 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  21.43 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  21.4 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  23.87 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  23.49 
 
 
860 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  21.32 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  24.51 
 
 
341 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  24.2 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  20 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  24.56 
 
 
340 aa  56.6  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  22.86 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  30.07 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0185  hypothetical protein  20.98 
 
 
350 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  24.91 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  22.11 
 
 
356 aa  47.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1064  protein of unknown function DUF354  22.84 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>