More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0028 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  100 
 
 		 373 aa  755    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  43.9 
 
 		 377 aa  328  8e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  50.49 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  35.69 
 
 		 367 aa  222  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 377 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.14 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 		 365 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.78 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  39.26 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.82 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 360 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 400 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 		 739 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  27.12 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 403 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.05 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.61 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  31.05 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 414 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 377 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 387 aa  92.8  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 411 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 370 aa  92.8  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3431  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 360 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 440 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.88 
 
 		 411 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 414 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 750 aa  89.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  25.71 
 
 		 382 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 		 417 aa  89.7  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 409 aa  89.7  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 405 aa  89.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 365 aa  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 439 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 753 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 439 aa  86.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.35 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 412 aa  85.9  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>