88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0025 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  855    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 		 463 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 433 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  26.98 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 546 aa  96.3  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 547 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 583 aa  80.5  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  22.48 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  21.36 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  22.3 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  24.44 
 
 		 506 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 482 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 449 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0601  putative membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25.51 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0736  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1352  polysaccharide biosynthesis protein  21.15 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 500 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.18 
 
 		 512 aa  55.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 477 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 		 500 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 899 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 475 aa  53.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2176  exporter of O-antigen and teichoic acid  26.55 
 
 		 456 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.311164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  26.1 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  33.66 
 
 		 517 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 499 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  23.17 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2586  polysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  30.51 
 
 		 505 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05840  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  20.24 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.597063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4438  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 483 aa  47  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 1103 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2014  O-antigen and teichoic acid-like export protein  25.6 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601988  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0789  integral membrane protein MviN  25.81 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0480496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1723  hypothetical protein  21.74 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.402773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 1103 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2064  polysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25 
 
 		 462 aa  44.3  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  37.86 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 479 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2946  hypothetical protein  29.34 
 
 		 359 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>