More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0011 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  100 
 
 
1138 aa  2300  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 
1049 aa  543  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.67 
 
 
1694 aa  524  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
4079 aa  389  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
927 aa  380  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 
1276 aa  352  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.32 
 
 
1979 aa  333  8e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
1069 aa  330  9e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
602 aa  272  3e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.41 
 
 
1056 aa  271  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
543 aa  268  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
562 aa  266  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.19 
 
 
1056 aa  258  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.29 
 
 
1022 aa  249  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.2 
 
 
1056 aa  243  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.63 
 
 
988 aa  229  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.25 
 
 
1067 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.85 
 
 
564 aa  218  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
878 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
711 aa  205  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.08 
 
 
1676 aa  201  8e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.47 
 
 
397 aa  192  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
750 aa  191  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.56 
 
 
810 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
617 aa  190  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  31.75 
 
 
573 aa  188  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
465 aa  186  2e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 
4489 aa  186  2e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.32 
 
 
818 aa  186  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 
784 aa  184  9e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.06 
 
 
784 aa  180  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  38.68 
 
 
344 aa  177  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
467 aa  177  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.28 
 
 
2240 aa  177  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.04 
 
 
1737 aa  176  2e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.92 
 
 
576 aa  175  4e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 
635 aa  174  8e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
366 aa  173  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  24.49 
 
 
1013 aa  171  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
329 aa  167  9e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.24 
 
 
730 aa  164  8e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.16 
 
 
706 aa  162  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
804 aa  162  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 
955 aa  162  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 
1297 aa  160  9e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
3035 aa  158  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
591 aa  157  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.57665e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
687 aa  157  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
1094 aa  156  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
1276 aa  156  3e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
605 aa  156  3e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 
1486 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.01 
 
 
707 aa  153  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
740 aa  152  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 
512 aa  151  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
935 aa  150  1e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.97 
 
 
632 aa  150  1e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.46 
 
 
462 aa  150  1e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
279 aa  149  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
1192 aa  148  7e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.99 
 
 
436 aa  146  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.09 
 
 
292 aa  146  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 
1421 aa  145  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.43 
 
 
1007 aa  144  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.85 
 
 
745 aa  144  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
414 aa  143  2e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 
409 aa  142  4e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
425 aa  142  5e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 
450 aa  140  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
747 aa  140  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.4 
 
 
887 aa  138  6e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 
3172 aa  137  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
486 aa  136  2e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 
409 aa  136  2e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  25 
 
 
706 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30 
 
 
398 aa  134  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
3560 aa  134  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.64 
 
 
936 aa  134  1e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
634 aa  133  2e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
662 aa  132  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  27.03 
 
 
331 aa  132  5e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
621 aa  131  7e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.6 
 
 
417 aa  131  8e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
402 aa  131  9e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
523 aa  130  1e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
391 aa  129  2e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
363 aa  129  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
393 aa  129  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
3301 aa  127  8e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
649 aa  128  8e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
393 aa  127  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.88 
 
 
626 aa  127  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.07 
 
 
623 aa  125  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 
409 aa  125  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 
565 aa  125  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 
296 aa  125  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 
594 aa  124  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.39 
 
 
833 aa  124  1e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.1 
 
 
725 aa  124  1e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  22.99 
 
 
791 aa  124  1e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>