More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_R0046 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_R0048  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000458542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000479411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-1  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00200335  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  94.74 
 
 		 378 bp  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt21  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  94.74 
 
 		 367 bp  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt21  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0052  tRNA-Val  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137415  normal  0.324257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0011  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0051  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0408927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0039  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0041  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0023  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000500863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0025  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0038  tRNA-Val  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0349926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0035  tRNA-Val  90.28 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0040  tRNA-Val  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000943403  normal  0.0843805 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0029  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000448285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0032  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.69442e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0020  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R10  tRNA-Val  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0061  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.03181 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0073  tRNA-Val  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.222054  normal  0.378802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0032  tRNA-Val  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000419269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0057  tRNA-Val  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00234927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0058  tRNA-Val  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00230233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0059  tRNA-Val  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00221278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60430  tRNA-Val  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0014  tRNA-Val  89.61 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.20827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0004  tRNA-Val  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000770056 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00016  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000202389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00018  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000172255  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00041  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000120834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00042  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000123332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00043  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000135072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0032  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0033  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139547  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0034  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000138641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0057  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0059  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  6.36722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2780  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000064612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2781  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000634028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0039  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2610  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000740519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2608  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000643017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0584  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.67929e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2676  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00067711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2674  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00824453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0879  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000126601  normal  0.645347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0038  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0815  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000696983  normal  0.877811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2609  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000718351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2560  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000861237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2039  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2650  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000507401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5021  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4681  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.95676e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2675  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000585827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0847  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0060  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00525968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0053  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0070  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000583072  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0767  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000989037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0072  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560906  normal  0.267671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0039  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  hitchhiker  0.00359795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0038  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000627564  hitchhiker  0.00122334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2555  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000393303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2554  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0769  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000076951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0054  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.444968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0040  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.37515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0058  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00534355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0037  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000578787  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2966  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.55159e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0059  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00482494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2967  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.52961e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3634  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000679496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0011  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3635  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0788  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000010379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1859  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00131515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0013  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4658  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.127679999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4683  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.66609e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0911  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000875601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2652  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000608087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2651  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000523066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2559  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5050  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5049  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603353  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4682  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.8092300000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4656  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.90971e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3636  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0665  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000217876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0849  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000146237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2556  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000389314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0052  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11446  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2561  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777875  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5051  tRNA-Val  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000673895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2837  tRNA-Val  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.88964e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>