224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_R0003 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0069  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0010  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0049  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0009  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0007  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0012  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0002  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0013  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000407891  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_003295  RS05586  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000136136  normal  0.200305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00107854  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0058  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136383  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0057  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00632698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3796  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000000939303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0019  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3086  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0049  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.323662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0052  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0078  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0058  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0060  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000611366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0013  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000164045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0012  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000183499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0010  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137284  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3188  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469441  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1904  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000012603  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3764  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3826  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.216257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0013  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179187  normal  0.143307 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3459  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000712395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0071  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000687699  normal  0.228297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0021  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0062  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0121694  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 71 bp  71.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0023  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0011  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  2.9187400000000002e-24  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0006  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.328073  hitchhiker  0.00695117 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0048  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  93.02 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0021  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01509  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0043  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2975  hypothetical protein  91.11 
 
 		 252 bp  58  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0065  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856118  normal  0.0346282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0004  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>