More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4250 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4250  DNA primase catalytic core  100 
 
 		 666 aa  1375    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  31.51 
 
 		 583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  30.45 
 
 		 599 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  33.15 
 
 		 584 aa  177  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  34.43 
 
 		 586 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  32.3 
 
 		 625 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  33.15 
 
 		 584 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  32.87 
 
 		 582 aa  174  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  33.15 
 
 		 588 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  30.92 
 
 		 651 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  31.97 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  31.37 
 
 		 660 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  31.97 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  31.97 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  31.93 
 
 		 586 aa  172  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  35.5 
 
 		 639 aa  171  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  31.37 
 
 		 660 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  31.13 
 
 		 660 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  30.68 
 
 		 598 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  31.28 
 
 		 576 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  30.29 
 
 		 652 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  31.22 
 
 		 581 aa  169  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  31.68 
 
 		 609 aa  169  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  33.78 
 
 		 639 aa  169  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  33.24 
 
 		 663 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  31.22 
 
 		 581 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  30.95 
 
 		 621 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  32.6 
 
 		 584 aa  167  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  31.22 
 
 		 581 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  31.22 
 
 		 581 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  31.22 
 
 		 581 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  31.22 
 
 		 581 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  30.66 
 
 		 660 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  33.15 
 
 		 598 aa  167  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  31.98 
 
 		 581 aa  166  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  31.4 
 
 		 660 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  30.84 
 
 		 663 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  31.98 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  31.98 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  31.98 
 
 		 581 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  31.96 
 
 		 584 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  31.98 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  31.93 
 
 		 623 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  31.98 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  32.42 
 
 		 664 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  31.98 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  31.98 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  31.98 
 
 		 581 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  30.41 
 
 		 605 aa  165  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  31.49 
 
 		 584 aa  165  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  29.5 
 
 		 666 aa  165  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  30.41 
 
 		 605 aa  165  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  32.6 
 
 		 588 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  32.14 
 
 		 660 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  30.27 
 
 		 656 aa  164  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.04 
 
 		 592 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  30.03 
 
 		 676 aa  163  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  30.39 
 
 		 655 aa  163  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  35.85 
 
 		 629 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  31.96 
 
 		 638 aa  162  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  33.33 
 
 		 574 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  33.33 
 
 		 626 aa  161  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  32.79 
 
 		 574 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  32.79 
 
 		 574 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  32.79 
 
 		 574 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  32.79 
 
 		 574 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  33.15 
 
 		 571 aa  160  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  34.42 
 
 		 575 aa  160  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  30.89 
 
 		 544 aa  160  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  32.15 
 
 		 574 aa  160  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  32.79 
 
 		 599 aa  160  9e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  31.81 
 
 		 574 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  32.15 
 
 		 576 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  35.48 
 
 		 642 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  34.68 
 
 		 583 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  33.24 
 
 		 588 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  34.5 
 
 		 641 aa  159  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1407  DNA primase  32.79 
 
 		 674 aa  159  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  31.91 
 
 		 677 aa  159  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  31.08 
 
 		 645 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  33.24 
 
 		 576 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  31.11 
 
 		 673 aa  158  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  34.77 
 
 		 641 aa  158  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  33.16 
 
 		 583 aa  158  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  33.16 
 
 		 583 aa  158  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  32.75 
 
 		 605 aa  158  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  32.07 
 
 		 618 aa  158  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  32.97 
 
 		 598 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  32.88 
 
 		 574 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  32.39 
 
 		 629 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  32.88 
 
 		 574 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  32.61 
 
 		 559 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  31.59 
 
 		 585 aa  156  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  29.79 
 
 		 577 aa  156  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  29.53 
 
 		 578 aa  156  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  33.68 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  32.25 
 
 		 573 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  31.71 
 
 		 669 aa  156  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  32.25 
 
 		 574 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  33.15 
 
 		 603 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>