80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4224 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
120 aa  247  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  41.28 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  42.06 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  38.53 
 
 
113 aa  93.6  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.81 
 
 
111 aa  90.5  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.38 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.27 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  37.27 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  37.27 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  37.27 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  37.27 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  37.27 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  37.27 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.19 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.27 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  37.27 
 
 
111 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.61 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.04 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.11 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  36.27 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.74 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.74 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.64 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.64 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.65 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.07 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.11 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3307  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.17 
 
 
48 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.07 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2885  PemK family protein  30 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.670266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  32.11 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  24.55 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  33.78 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.11 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.14 
 
 
134 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  29.52 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  29.52 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  29.52 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.74 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.52 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  29.52 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4757  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40 
 
 
115 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424428  normal  0.0249219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.43 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2716  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.9 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.28 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  25.74 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0402  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.08 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.55 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  29.36 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1640  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  28.3 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0998854  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  33.33 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0962  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  29.36 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.26 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  27.18 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.85 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  30.43 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11123  hypothetical protein  28.89 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  28.85 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.25 
 
 
118 aa  42  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30 
 
 
116 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  29.81 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1313  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.23 
 
 
119 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56564  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30 
 
 
116 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.07 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  27.03 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.24 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3386  PemK family protein  28.12 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474418  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1327  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.56 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  25 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.48 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1737  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.9 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.64 
 
 
117 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.96 
 
 
112 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.653702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>