42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4162 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4162  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  197  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4794  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3693  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  48.98 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  decreased coverage  0.000194447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3313  H-NS family protein MvaT  50.94 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.724808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2443  hypothetical protein  55 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0503835  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0128  hypothetical protein  44.26 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2608  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  59.52 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000264068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2947  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  51.06 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194319  normal  0.217791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0281  hypothetical protein  49.15 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2795  H-NS family protein MvaT  54.9 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4167  hypothetical protein  47.37 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189495  normal  0.273328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4437  H-NS family protein MvaT  49.06 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00708385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3014  hypothetical protein  42.65 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38310  Transcriptional regulator MvaT  48.89 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0396822  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3337  transcriptional regulator, putative  50 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2960  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1366  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  45 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000478135  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56070  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  43.1 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0979321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2345  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4019  transcriptional regulator, putative  41.1 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000036562  normal  0.0246266 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_4315  transcriptional regulator, putative  41.1 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000286205  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4883  transcriptional regulator MvaT  47.92 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4357  hypothetical protein  45 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.00000000000135149  normal  0.0272701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1006  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  52.5 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000105934  hitchhiker  0.0000000000004027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3103  transcriptional regulator, putative  55 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000951367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2971  transcriptional regulator, putative  55 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0855395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0009  hypothetical protein  42.42 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000754026  normal  0.103636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0009  hypothetical protein  42.42 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4448  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  52.5 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000222895  hitchhiker  0.00000983981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0017  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  42.42 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499101  unclonable  0.000000189493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0011  hypothetical protein  42.42 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1634  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0882393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1652  H-NS family protein MvaT  47.46 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4755  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2921  H-NS family protein MvaT  55 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0220889  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2532  hypothetical protein  52.5 
 
 		 117 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5037  hypothetical protein  43.1 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.038586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2102  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  52.5 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.313756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29590  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.656804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2138  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  57.14 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000737433  hitchhiker  0.00000269456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3765  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  57.14 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1998  hypothetical protein  52.5 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.989293  hitchhiker  0.000130496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>