42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3731 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  49.23 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  41.61 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.58 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.15 
 
 
143 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  43.85 
 
 
141 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.42 
 
 
143 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.69 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  37.69 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  37.69 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  36.64 
 
 
145 aa  94.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  35.61 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.85 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  35.61 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  31.88 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  31.88 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  31.88 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  37.3 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  37.01 
 
 
135 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  36.04 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  35.48 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  36.51 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  36 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  30.83 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.37 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  33.93 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  33.61 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  33.61 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  34.26 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  30.39 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  31.53 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  30.43 
 
 
165 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  36.14 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  28.21 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  30.43 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  31.52 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  30.43 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  30.43 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  31.52 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  31.52 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  30.43 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>