More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3723 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3723  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  100 
 
 
521 aa  1060    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.946977  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0020  sigma-54 dependent transcriptional regulator  45.63 
 
 
530 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1206  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.78 
 
 
516 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.628402  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2519  putative sigma54 specific transcriptional regulator  43.66 
 
 
517 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.431147  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0424  Sigma 54 interacting domain protein  43.05 
 
 
533 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3245  Sigma 54 interacting domain protein  41.68 
 
 
512 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2797  putative sigma54 specific transcriptional regulator  44.91 
 
 
512 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0054  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.87 
 
 
525 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1080  Sigma 54 interacting domain protein  42.45 
 
 
512 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1613  Sigma 54 interacting domain protein  42.28 
 
 
532 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2692  putative sigma54 specific transcriptional regulator  43.42 
 
 
532 aa  343  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05873  nitric oxide reductase regulator  37.14 
 
 
542 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000451  transcriptional regulator  36.92 
 
 
543 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.219758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2345  two component signal transduction response regulator  41.35 
 
 
455 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1577  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.58 
 
 
458 aa  257  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0548  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.14 
 
 
452 aa  256  8e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.902927  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  40.92 
 
 
461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  40.92 
 
 
461 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.92 
 
 
461 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  40.92 
 
 
461 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  40.92 
 
 
461 aa  254  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  40.92 
 
 
461 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0111  sigma-54 dependent transcriptional regulator  46.25 
 
 
439 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2549  sigma-54 dependent transcriptional regulator  43.48 
 
 
509 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0908365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2062  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.48 
 
 
449 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000496565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2100  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.48 
 
 
466 aa  252  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0568  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.09 
 
 
489 aa  252  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3798  helix-turn-helix, Fis-type  42.27 
 
 
558 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.852136  hitchhiker  0.00299193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0098  Fis family transcriptional regulator  39.52 
 
 
510 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2658  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.24 
 
 
458 aa  250  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2018  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.46 
 
 
447 aa  250  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0077  helix-turn-helix, Fis-type  46.2 
 
 
439 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2353  phosphocarrier HPr/sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  38.59 
 
 
668 aa  249  8e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0776  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.72 
 
 
454 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.24 
 
 
468 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428008  normal  0.0222917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2534  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.57 
 
 
517 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0433  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.33 
 
 
472 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2362  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.06 
 
 
479 aa  248  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2667  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  38.32 
 
 
668 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4373  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.62 
 
 
491 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5108  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  41.19 
 
 
684 aa  247  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5424  sigma-54 dependent transcriptional regulator  42.37 
 
 
505 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1494  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.62 
 
 
491 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.04 
 
 
467 aa  247  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000637809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3934  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.62 
 
 
491 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0125  response regulator receiver protein  37.53 
 
 
460 aa  247  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.847419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2280  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.07 
 
 
453 aa  247  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3288  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.67 
 
 
463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4274  transcriptional regulator FleQ  41.8 
 
 
490 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3003  two component Fis family transcriptional regulator  41.23 
 
 
465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  41.46 
 
 
460 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4159  sigma-54 dependent transcriptional regulator, Fis family  42.17 
 
 
592 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.778459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50220  transcriptional regulator FleQ  41.8 
 
 
490 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000359147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.64 
 
 
467 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3194  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.9 
 
 
592 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0889  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 
457 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.562969  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.52 
 
 
459 aa  246  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2826  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.48 
 
 
461 aa  246  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.94 
 
 
460 aa  246  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5583  Fis family transcriptional regulator  41.59 
 
 
508 aa  246  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.468143  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0823  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.02 
 
 
592 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2158  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.62 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0884  transcriptional regulator FleQ  43.03 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0839  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  42.02 
 
 
592 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1292  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.55 
 
 
466 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3029  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.02 
 
 
592 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3698  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.4 
 
 
491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4653  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.87 
 
 
517 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.38 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3002  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.81 
 
 
592 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1129  sigma-54 dependent response regulator  40.54 
 
 
484 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1847  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.68 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.122843  normal  0.436579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4024  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.75 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42797e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2829  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.85 
 
 
491 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  hitchhiker  0.00432701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1840  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.51 
 
 
456 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000468493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0110  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.2 
 
 
457 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.200769  normal  0.23433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.88 
 
 
453 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0109  two component Fis family transcriptional regulator  40.11 
 
 
466 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0106  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.77 
 
 
459 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.327572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0925  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.05 
 
 
500 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.68 
 
 
469 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0915  transcriptional regulator FleQ  42.73 
 
 
471 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1954  transcriptional regulator FleQ  40.53 
 
 
491 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.46 
 
 
461 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000196128  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1976  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family protein  40.67 
 
 
438 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1157  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  35.94 
 
 
502 aa  243  5e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0344  two component Fis family transcriptional regulator  42.74 
 
 
452 aa  243  6e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0882822  normal  0.355114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.3 
 
 
481 aa  243  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.481364  normal  0.940549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0300  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.17 
 
 
457 aa  243  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001184  putative two-component response regulator  45.18 
 
 
443 aa  243  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02702  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.72 
 
 
592 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1532  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.67 
 
 
491 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497768  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0516  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.66 
 
 
468 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000971097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02664  hypothetical protein  41.72 
 
 
592 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42970  putative transcriptional regulator  42.5 
 
 
503 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.076623  normal  0.105875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.79 
 
 
469 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2269  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.98 
 
 
493 aa  243  9e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3461  helix-turn-helix, Fis-type  40.81 
 
 
491 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0070  putative sigma54 specific transcriptional regulator  45.89 
 
 
434 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.000000158676 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2001  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.89 
 
 
482 aa  242  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>