More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3719 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  86.45 
 
 
706 aa  1223    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  83.88 
 
 
687 aa  1162    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  83.88 
 
 
687 aa  1162    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  83.88 
 
 
687 aa  1162    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
723 aa  1516    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  47.46 
 
 
678 aa  625  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  46.94 
 
 
678 aa  623  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  48.84 
 
 
1017 aa  615  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  46.61 
 
 
694 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  46.92 
 
 
656 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  47.01 
 
 
655 aa  601  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  46.89 
 
 
1095 aa  598  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  44.86 
 
 
727 aa  598  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  46.83 
 
 
617 aa  591  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  46.68 
 
 
697 aa  591  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  46.83 
 
 
617 aa  589  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  48.36 
 
 
609 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  46.51 
 
 
617 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  48.21 
 
 
619 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  46.07 
 
 
615 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  45.79 
 
 
610 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  46.1 
 
 
616 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  44.11 
 
 
682 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  46.82 
 
 
617 aa  569  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  46.55 
 
 
618 aa  571  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  43.55 
 
 
694 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  44.38 
 
 
655 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  44.13 
 
 
699 aa  559  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  43.75 
 
 
706 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  42.06 
 
 
732 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  41.96 
 
 
740 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  41.96 
 
 
740 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  42.67 
 
 
741 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  42.67 
 
 
741 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  42.11 
 
 
725 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  36.86 
 
 
722 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  38.93 
 
 
684 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  39.74 
 
 
680 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  40.79 
 
 
713 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  38.74 
 
 
771 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  40 
 
 
678 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  39.43 
 
 
693 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  38.11 
 
 
704 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  35.03 
 
 
722 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  39.88 
 
 
763 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  38.01 
 
 
706 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 
722 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  40.99 
 
 
725 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  36.9 
 
 
725 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  37.92 
 
 
692 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  38.57 
 
 
726 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  39.56 
 
 
680 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  39.53 
 
 
702 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  39.35 
 
 
702 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  39.66 
 
 
702 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  38.61 
 
 
694 aa  439  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  39.03 
 
 
688 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  40.03 
 
 
633 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  40.19 
 
 
633 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  38.77 
 
 
713 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  40.19 
 
 
633 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  39.62 
 
 
790 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  38.64 
 
 
680 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  38.77 
 
 
713 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  37.85 
 
 
702 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  39.87 
 
 
633 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  38.92 
 
 
713 aa  432  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  36.52 
 
 
680 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  39.84 
 
 
808 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  37.7 
 
 
680 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  38.23 
 
 
741 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.65 
 
 
683 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  35.41 
 
 
754 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  34.52 
 
 
754 aa  392  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  33.73 
 
 
683 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  33.43 
 
 
692 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  43.35 
 
 
1019 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  43.06 
 
 
1019 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  33.13 
 
 
692 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  42.33 
 
 
842 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  33.53 
 
 
771 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  35.96 
 
 
671 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  34.09 
 
 
691 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  33.77 
 
 
675 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  36.08 
 
 
1118 aa  362  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  34.87 
 
 
675 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  34.7 
 
 
689 aa  353  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  62.36 
 
 
320 aa  352  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  39.23 
 
 
968 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  34.55 
 
 
709 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  32.84 
 
 
646 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  35.26 
 
 
697 aa  320  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  36.12 
 
 
668 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  32.87 
 
 
661 aa  317  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  33.12 
 
 
643 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  34.44 
 
 
668 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  31.83 
 
 
741 aa  313  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  32.87 
 
 
661 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  32.87 
 
 
661 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  32.87 
 
 
661 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>