134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3619 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3619  tRNA 2-selenouridine synthase  100 
 
 
367 aa  753    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0794  hypothetical protein  52.08 
 
 
366 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3754  tRNA 2-selenouridine synthase  54.27 
 
 
367 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0900033  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0697  tRNA 2-selenouridine synthase  51.39 
 
 
366 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0822  tRNA 2-selenouridine synthase  51.24 
 
 
370 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0849  tRNA 2-selenouridine synthase  51.24 
 
 
370 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3629  tRNA 2-selenouridine synthase  51.37 
 
 
369 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4364  tRNA 2-selenouridine synthase  51.52 
 
 
365 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.307655  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43270  tRNA 2-selenouridine synthase  51.1 
 
 
369 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.829954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10190  tRNA 2-selenouridine synthase  53.33 
 
 
370 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0189  tRNA 2-selenouridine synthase  50 
 
 
367 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0697371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3544  tRNA 2-selenouridine synthase  49.03 
 
 
369 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0863  tRNA 2-selenouridine synthase  50.69 
 
 
370 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0301  tRNA 2-selenouridine synthase  51.1 
 
 
366 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4081  tRNA 2-selenouridine synthase  49.86 
 
 
368 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0172  tRNA 2-selenouridine synthase  49.86 
 
 
368 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0160  tRNA 2-selenouridine synthase  50 
 
 
365 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.334237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0227  tRNA 2-selenouridine synthase  50.56 
 
 
367 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.254912  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0119  tRNA 2-selenouridine synthase  48.36 
 
 
366 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4183  tRNA 2-selenouridine synthase  49.3 
 
 
368 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2454  tRNA 2-selenouridine synthase  52.07 
 
 
373 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156444  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4342  tRNA 2-selenouridine synthase  49.3 
 
 
369 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  hitchhiker  0.00245617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0176  tRNA 2-selenouridine synthase  49.58 
 
 
368 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4714  tRNA 2-selenouridine synthase  49 
 
 
368 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728347  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0169  tRNA 2-selenouridine synthase  49.58 
 
 
369 aa  359  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0272703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0174  tRNA 2-selenouridine synthase  49.58 
 
 
384 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0195  tRNA 2-selenouridine synthase  49 
 
 
376 aa  359  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0175  tRNA 2-selenouridine synthase  49.01 
 
 
365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0134  tRNA 2-selenouridine synthase  47.5 
 
 
372 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1023  tRNA 2-selenouridine synthase  47.37 
 
 
374 aa  348  9e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0769  tRNA 2-selenouridine synthase  48.42 
 
 
372 aa  346  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.649423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1622  tRNA 2-selenouridine synthase  47.92 
 
 
365 aa  342  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2719  tRNA 2-selenouridine synthase  47.34 
 
 
372 aa  338  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0975  tRNA 2-selenouridine synthase  47.04 
 
 
356 aa  334  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.432685  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0560  tRNA 2-selenouridine synthase  46.3 
 
 
364 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.556907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0285  tRNA 2-selenouridine synthase  45.51 
 
 
365 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0621  tRNA 2-selenouridine synthase  45.75 
 
 
364 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.545594  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0567  tRNA 2-selenouridine synthase  45.75 
 
 
364 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0562  tRNA 2-selenouridine synthase  45.48 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1161  tRNA 2-selenouridine synthase  44.48 
 
 
364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.965775  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0577  tRNA 2-selenouridine synthase  46.11 
 
 
361 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0437  tRNA 2-selenouridine synthase  44.96 
 
 
364 aa  325  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0546  tRNA 2-selenouridine synthase  44.96 
 
 
364 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00453  tRNA 2-selenouridine synthase, selenophosphate-dependent  44.69 
 
 
364 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3109  tRNA 2-selenouridine synthase  44.69 
 
 
364 aa  323  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00458  hypothetical protein  44.69 
 
 
364 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0540  tRNA 2-selenouridine synthase  44.96 
 
 
364 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0577  tRNA 2-selenouridine synthase  44.41 
 
 
364 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3119  tRNA 2-selenouridine synthase  44.41 
 
 
364 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0604  tRNA 2-selenouridine synthase  44.41 
 
 
364 aa  322  6e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2396  tRNA 2-selenouridine synthase  44.38 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0512  tRNA 2-selenouridine synthase  43.73 
 
 
361 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114346  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1272  tRNA 2-selenouridine synthase  36.86 
 
 
347 aa  175  9e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4284  rhodanese-like protein  34.43 
 
 
339 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812807 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16371  tRNA 2-selenouridine synthase  35.21 
 
 
366 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.218284 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07211  tRNA 2-selenouridine synthase  33.63 
 
 
347 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1198  tRNA 2-selenouridine synthase  34.94 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07681  tRNA 2-selenouridine synthase  32.01 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104212  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0136  tRNA 2-selenouridine synthase  31.44 
 
 
350 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4991  tRNA 2-selenouridine synthase  33.83 
 
 
358 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0663375  normal  0.0359024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3113  tRNA 2-selenouridine synthase  36.17 
 
 
354 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.227771  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0043  tRNA 2-selenouridine synthase  32.4 
 
 
346 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1933  tRNA 2-selenouridine synthase  32.74 
 
 
375 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1190  tRNA 2-selenouridine synthase  34.81 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000287258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0278  tRNA 2-selenouridine synthase  32.96 
 
 
344 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2383  tRNA 2-selenouridine synthase  30.85 
 
 
346 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2386  tRNA 2-selenouridine synthase  31.37 
 
 
335 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1757  tRNA 2-selenouridine synthase  36.25 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3859  tRNA 2-selenouridine synthase  33.44 
 
 
353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2384  tRNA 2-selenouridine synthase  33.44 
 
 
345 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.55321e-16  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0948  tRNA 2-selenouridine synthase  33.54 
 
 
338 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113987  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2803  tRNA 2-selenouridine synthase  35.8 
 
 
349 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3480  tRNA 2-selenouridine synthase  35.39 
 
 
373 aa  143  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09351  tRNA 2-selenouridine synthase  30.65 
 
 
346 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09341  tRNA 2-selenouridine synthase  29.88 
 
 
346 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0875  tRNA 2-selenouridine synthase  28.74 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3539  tRNA 2-selenouridine synthase  32.25 
 
 
349 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3301  tRNA 2-selenouridine synthase  30.77 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230491  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1887  tRNA 2-selenouridine synthase  32.36 
 
 
344 aa  137  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.739187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3666  tRNA 2-selenouridine synthase  35.06 
 
 
356 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3032  tRNA 2-selenouridine synthase  31.87 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000366048  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1887  tRNA 2-selenouridine synthase  37.1 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227051  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2244  tRNA 2-selenouridine synthase  31.19 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.590434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1645  tRNA 2-selenouridine synthase  35.6 
 
 
377 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2715  tRNA 2-selenouridine synthase  31.02 
 
 
353 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370816 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0932  tRNA 2-selenouridine synthase  35.37 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1349  tRNA 2-selenouridine synthase  31.5 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0754  tRNA 2-selenouridine synthase  35.37 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0765  tRNA 2-selenouridine synthase  35.37 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1525  tRNA 2-selenouridine synthase  30.41 
 
 
346 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0672649  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3699  tRNA 2-selenouridine synthase  35.48 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.919346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0620  tRNA 2-selenouridine synthase  35.37 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1508  tRNA 2-selenouridine synthase  34.52 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154037  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2556  tRNA 2-selenouridine synthase  35.48 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2691  tRNA 2-selenouridine synthase  29.82 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.7307300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1569  tRNA 2-selenouridine synthase  34.52 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.866156  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1112  tRNA 2-selenouridine synthase  34.68 
 
 
375 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1488  tRNA 2-selenouridine synthase  34.52 
 
 
375 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1592  tRNA 2-selenouridine synthase  34.68 
 
 
375 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0414382  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_10242  predicted protein  29.63 
 
 
295 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.85356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>