More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3454 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  922    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  41.7 
 
 
424 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  40.69 
 
 
414 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  37.76 
 
 
374 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  35.41 
 
 
437 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  32.67 
 
 
433 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  31.84 
 
 
444 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  31.94 
 
 
439 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  38.07 
 
 
374 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  31.61 
 
 
444 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  33.11 
 
 
442 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  33.26 
 
 
468 aa  210  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  31.34 
 
 
487 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  31.92 
 
 
447 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  30.4 
 
 
506 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  30.29 
 
 
436 aa  206  6e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  32.5 
 
 
446 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  32.07 
 
 
446 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  31.61 
 
 
442 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  30.35 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  31.77 
 
 
819 aa  201  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  30.27 
 
 
437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  30.6 
 
 
436 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  30.6 
 
 
436 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  30.6 
 
 
436 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  33.79 
 
 
374 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  31.37 
 
 
420 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  30.09 
 
 
398 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  30.8 
 
 
433 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  31.11 
 
 
448 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  29.35 
 
 
412 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  30.67 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  29.21 
 
 
417 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  28.64 
 
 
416 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  32.51 
 
 
386 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 
416 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  31.67 
 
 
427 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  31.26 
 
 
409 aa  166  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  30.72 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  31.78 
 
 
416 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  30.41 
 
 
425 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  30.68 
 
 
442 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  31.65 
 
 
423 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  29.66 
 
 
766 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  31.13 
 
 
429 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  28.98 
 
 
434 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  28.44 
 
 
412 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  29.01 
 
 
434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  29.37 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  28.45 
 
 
437 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  31.21 
 
 
425 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  29.35 
 
 
418 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  29.85 
 
 
423 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  29.36 
 
 
438 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  29.5 
 
 
425 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  29.07 
 
 
428 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  29.81 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  28.22 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  28.88 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  27.99 
 
 
441 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  29.46 
 
 
433 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  26.39 
 
 
425 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  26.62 
 
 
432 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  29.98 
 
 
455 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  27.62 
 
 
432 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  29.27 
 
 
439 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  29.04 
 
 
428 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  28.51 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  26.47 
 
 
432 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  29.4 
 
 
447 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  28.89 
 
 
437 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  29.23 
 
 
425 aa  136  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  27.52 
 
 
386 aa  136  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1575  protein of unknown function DUF323  28.63 
 
 
430 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  27.49 
 
 
422 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0918  hypothetical protein  27.92 
 
 
418 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  27.06 
 
 
420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  28.97 
 
 
433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  27.25 
 
 
429 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  27.31 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  29.86 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  28.1 
 
 
385 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  26.84 
 
 
398 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  28.57 
 
 
470 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  27.72 
 
 
417 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  27.92 
 
 
418 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  29.17 
 
 
433 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  26.46 
 
 
412 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  30.15 
 
 
453 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  28.02 
 
 
430 aa  124  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  28.85 
 
 
383 aa  123  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  28.19 
 
 
384 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  28.07 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  30.13 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  28.44 
 
 
723 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  27.63 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  25.49 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  26.87 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  27.13 
 
 
426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>