More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3409 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  59.61 
 
 		 214 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  65.95 
 
 		 212 aa  251  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 211 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 213 aa  250  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  65.03 
 
 		 212 aa  247  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  65.03 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  65.03 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  65.03 
 
 		 212 aa  240  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 186 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 210 aa  238  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 186 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  53.73 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  54.46 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  51.91 
 
 		 219 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  51.6 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  52.58 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 179 aa  208  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  44.51 
 
 		 193 aa  175  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  52.7 
 
 		 162 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 196 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  41.3 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 193 aa  154  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 202 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  33.86 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 200 aa  101  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 190 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 199 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  30.68 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  31.12 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 200 aa  88.6  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 206 aa  88.2  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  30.94 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_01619  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.55 
 
 		 171 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000798557  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_01609  hypothetical protein  33.55 
 
 		 171 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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