143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3382 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 485 aa  1004    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  44.54 
 
 		 451 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  35.88 
 
 		 483 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  31.34 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0987  restriction modification system DNA specificity subunit  30.26 
 
 		 390 aa  157  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  48.3 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  45.3 
 
 		 514 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  25.81 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  28.53 
 
 		 424 aa  144  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  28.66 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  40.11 
 
 		 437 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  25.61 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  29.18 
 
 		 549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  40.88 
 
 		 386 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.32 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  37.28 
 
 		 412 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  26.19 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  39.41 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  28.49 
 
 		 416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  28.36 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2893  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.23 
 
 		 237 aa  114  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  28.03 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.06 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  26.23 
 
 		 458 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  31.58 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  30.03 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  25.21 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  30.03 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  28.95 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  23.47 
 
 		 425 aa  107  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  25.47 
 
 		 415 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 447 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  23.55 
 
 		 422 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  25.61 
 
 		 417 aa  103  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1398  restriction modification system DNA specificity subunit  32.32 
 
 		 557 aa  103  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  32.81 
 
 		 392 aa  103  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  33.67 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  25.49 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.12 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.66 
 
 		 412 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.54 
 
 		 428 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.4 
 
 		 428 aa  97.1  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  28.47 
 
 		 416 aa  90.1  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  29.63 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  21.88 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  33.56 
 
 		 180 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0307222  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.77 
 
 		 620 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  43.33 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.44 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  29.48 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  29.06 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  29.89 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.41 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  19.42 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.71 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  23.22 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  31.58 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  27.13 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  26.84 
 
 		 351 aa  67  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.41 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  26.4 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  26.4 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.3 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  38.37 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  22.87 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  27.93 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  24.29 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4139  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.41 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  34.29 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  32 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  24.51 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  27.68 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  27.37 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  33.33 
 
 		 420 aa  60.1  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  24.55 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  23.6 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  31.2 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  23.86 
 
 		 775 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  23.51 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.39 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.16 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02074  HsdS polypeptide, part of CfrA family  38.55 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  24.06 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  28.19 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  30 
 
 		 401 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  31.25 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0870  restriction modification system DNA specificity subunit  34.07 
 
 		 195 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1414  restriction modification system DNA specificity domain  23.49 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00014984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  26.73 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  27.13 
 
 		 429 aa  53.9  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.72 
 
 		 422 aa  53.9  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  27.88 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  28.46 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  20.88 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  23.88 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  26.14 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  23.68 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.31 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  25.76 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  23.16 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>