More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3363 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  100 
 
 
245 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  58.73 
 
 
210 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  56.88 
 
 
186 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  54.17 
 
 
184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  56.88 
 
 
185 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  56.88 
 
 
185 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  51.67 
 
 
194 aa  178  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  51.08 
 
 
189 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  56.33 
 
 
187 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  50.6 
 
 
187 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  53.75 
 
 
189 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  50.6 
 
 
187 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  51.79 
 
 
184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  45.5 
 
 
186 aa  165  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  45.77 
 
 
195 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 
195 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  44.39 
 
 
189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  51.33 
 
 
199 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  51.33 
 
 
199 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  54.42 
 
 
185 aa  161  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  44.78 
 
 
195 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  57.64 
 
 
181 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  58.33 
 
 
178 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  58.33 
 
 
185 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  58.33 
 
 
185 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  58.33 
 
 
185 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  58.33 
 
 
185 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  58.33 
 
 
185 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  58.33 
 
 
185 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  58.33 
 
 
185 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  54.25 
 
 
192 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  46.43 
 
 
192 aa  158  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  46.43 
 
 
192 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  46.43 
 
 
192 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  56.25 
 
 
181 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  56.25 
 
 
181 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  56.25 
 
 
181 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  56.94 
 
 
181 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0644  heat shock protein GrpE  56.25 
 
 
181 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  47.7 
 
 
211 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0667  heat shock protein GrpE  56.25 
 
 
181 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151401  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  43.28 
 
 
195 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  52.63 
 
 
187 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  52.05 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  41.2 
 
 
212 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  47.2 
 
 
209 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  48.39 
 
 
205 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  56 
 
 
194 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  49.04 
 
 
201 aa  151  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  56.46 
 
 
202 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  47.19 
 
 
206 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  46.67 
 
 
193 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  46.67 
 
 
190 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  54.67 
 
 
194 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  47.1 
 
 
209 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  48 
 
 
200 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  50.34 
 
 
195 aa  149  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  47.59 
 
 
200 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  47.13 
 
 
209 aa  148  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  50.32 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  50 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  44.44 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  47.67 
 
 
190 aa  146  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 
200 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 
196 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  49.68 
 
 
215 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  45 
 
 
218 aa  144  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  45.45 
 
 
197 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 
197 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  45.45 
 
 
197 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 
197 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 
197 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
197 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 
196 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  48.61 
 
 
201 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  47.59 
 
 
206 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  45.16 
 
 
203 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  45.12 
 
 
197 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  46.9 
 
 
206 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  49.68 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  46.9 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  46.9 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  46.9 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  49.33 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  46.9 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  46.21 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 
203 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  47.27 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  45.24 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  50.68 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  45.24 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  45.24 
 
 
196 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  45.24 
 
 
196 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  45.24 
 
 
196 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  40.86 
 
 
180 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  41.24 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  45.28 
 
 
184 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  47.8 
 
 
179 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  50.68 
 
 
184 aa  135  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  46.05 
 
 
208 aa  135  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>