More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3306 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  515  1e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  46.06 
 
 
259 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  46.47 
 
 
251 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  45.64 
 
 
263 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  45.64 
 
 
254 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  46.47 
 
 
251 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  46.89 
 
 
259 aa  204  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  46.38 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  46.38 
 
 
256 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  46.03 
 
 
263 aa  200  2e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  45.96 
 
 
256 aa  200  2e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  44.81 
 
 
254 aa  199  4e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  45.23 
 
 
255 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  46.38 
 
 
255 aa  196  2e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  45.64 
 
 
257 aa  194  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  45.96 
 
 
255 aa  183  2e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7453  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  47.69 
 
 
253 aa  174  1e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.92 
 
 
254 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  39.92 
 
 
254 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.92 
 
 
254 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.92 
 
 
254 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.92 
 
 
256 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  39.92 
 
 
254 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  39.92 
 
 
254 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
261 aa  165  7e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  40.34 
 
 
258 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
257 aa  162  5e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  38.33 
 
 
252 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  38.43 
 
 
255 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  3.78938e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 
257 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
257 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
258 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
255 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  38.43 
 
 
255 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  37.78 
 
 
251 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
255 aa  155  5e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  38.43 
 
 
255 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  40.79 
 
 
261 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 
255 aa  147  1e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 
256 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.74 
 
 
257 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  36.84 
 
 
254 aa  141  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  36.84 
 
 
254 aa  141  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.50379e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  36.84 
 
 
254 aa  141  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  36.84 
 
 
254 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  36.84 
 
 
254 aa  141  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  6.5438e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  36.84 
 
 
254 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  36.84 
 
 
254 aa  141  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  36.84 
 
 
254 aa  141  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  36.84 
 
 
254 aa  141  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  35.84 
 
 
254 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  35.84 
 
 
254 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  35.84 
 
 
254 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  35.84 
 
 
254 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  36.41 
 
 
245 aa  140  2e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.85286e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  35.84 
 
 
254 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  38.1 
 
 
285 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
255 aa  139  5e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  34.41 
 
 
254 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  36.32 
 
 
255 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
270 aa  136  3e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.46 
 
 
268 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  36.28 
 
 
254 aa  135  7e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  35.16 
 
 
270 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  5.482e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  35.34 
 
 
255 aa  133  2e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  35.34 
 
 
255 aa  134  2e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
255 aa  133  2e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.47 
 
 
258 aa  132  4e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
228 aa  132  4e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  34.05 
 
 
254 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.47 
 
 
258 aa  132  7e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  34.47 
 
 
250 aa  132  7e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.47 
 
 
258 aa  132  7e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.47 
 
 
258 aa  132  8e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.47 
 
 
258 aa  132  8e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  34.47 
 
 
258 aa  132  8e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.47 
 
 
258 aa  132  8e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  34.47 
 
 
258 aa  132  8e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  34.47 
 
 
258 aa  132  8e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
239 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
239 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.87 
 
 
258 aa  131  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
239 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
233 aa  131  1e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
248 aa  131  1e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  34.76 
 
 
257 aa  130  2e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.04 
 
 
258 aa  130  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
318 aa  130  2e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.04 
 
 
258 aa  130  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  36.4 
 
 
248 aa  130  2e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 
270 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.04 
 
 
258 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 
278 aa  129  5e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  33.62 
 
 
254 aa  129  5e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  33.62 
 
 
254 aa  129  5e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.04 
 
 
258 aa  129  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  33.63 
 
 
248 aa  129  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
288 aa  128  8e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  34.32 
 
 
250 aa  127  2e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  34.05 
 
 
254 aa  127  2e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>