251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3273 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3273  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  100 
 
 
298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00248567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1294  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  95.97 
 
 
298 aa  581  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3210  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  95.97 
 
 
298 aa  581  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2326  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  68.9 
 
 
298 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1104  CDF family heavy metal efflux protein  69.23 
 
 
298 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1118  CDF family heavy metal efflux protein  69.23 
 
 
298 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2903  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  69.23 
 
 
298 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1605  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  69.23 
 
 
298 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2911  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  69.23 
 
 
298 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0391  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  69.23 
 
 
298 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0883  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  69.23 
 
 
298 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3474  cation efflux system permease, putative  68.69 
 
 
298 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0195  cation efflux system permease, putative  68.46 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0221  cation efflux system permease, putative  68.46 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4003  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  67.89 
 
 
298 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0471  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  65.89 
 
 
298 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1408  cation efflux system permease, putative  65.44 
 
 
298 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0890  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  71.6 
 
 
258 aa  348  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4157  Co/Zn/Cd efflux system component  55.37 
 
 
299 aa  318  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0229  cation efflux system permease, putative  54.22 
 
 
301 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0694  Co/Zn/Cd efflux system component  53.9 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1972  cation efflux system permease, putative  54.88 
 
 
301 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3334  Co/Zn/Cd efflux system component  54.38 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3144  Co/Zn/Cd efflux system component  54.41 
 
 
272 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0859  Co/Zn/Cd efflux system component  52.52 
 
 
303 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.850247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2374  Co/Zn/Cd efflux system component  50 
 
 
272 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1960  Co/Zn/Cd efflux system component  48.7 
 
 
303 aa  242  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0317044  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0699  cation efflux protein  47.06 
 
 
276 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0094  cation efflux protein  59.78 
 
 
203 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3093  cation efflux protein  46.44 
 
 
272 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2141  cation efflux protein  60.23 
 
 
201 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0409  cation efflux protein  57.69 
 
 
204 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2838  cation efflux protein  45.32 
 
 
269 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02025  Cation efflux protein  51.35 
 
 
205 aa  189  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.550382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1855  cation efflux protein  50.83 
 
 
209 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2025  cation efflux protein  50 
 
 
211 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2867  cation efflux protein  45.36 
 
 
232 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000803001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1922  cation efflux protein  48.9 
 
 
208 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00533628  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1956  putative RND efflux system protein  47.16 
 
 
207 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4214  Co/Zn/Cd efflux system component  46.96 
 
 
208 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3207  Co/Zn/Cd efflux system component  41.42 
 
 
205 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750321  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3624  cation efflux protein  39.78 
 
 
206 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383775  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3962  cation efflux protein  39.78 
 
 
206 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0859119  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2355  RND OM export protein  45.6 
 
 
200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2582  cation efflux protein  42.08 
 
 
209 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2054  cation efflux protein  39.31 
 
 
208 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.450484  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  35.75 
 
 
266 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2424  cation efflux permease, putative  39.31 
 
 
208 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1534  cation efflux protein  34.69 
 
 
225 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3968  cation efflux protein  31.14 
 
 
283 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1006  cation efflux protein  40.35 
 
 
216 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4424  cation efflux protein  38.55 
 
 
208 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01511  hypothetical protein  32.02 
 
 
209 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2575  cation efflux protein  38.2 
 
 
208 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2332  cation efflux protein  37.42 
 
 
211 aa  105  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275575  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2150  cation efflux protein  43.23 
 
 
207 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359079  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2983  cation efflux protein  36.36 
 
 
222 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2151  cation efflux protein  36.67 
 
 
208 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1655  hypothetical protein  35.47 
 
 
210 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460988  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1156  cation efflux protein  35 
 
 
205 aa  102  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2573  cation efflux protein  37.1 
 
 
216 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3833  cation efflux protein  38.73 
 
 
213 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0953841  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0136  cation efflux protein  39.53 
 
 
228 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24510  cation efflux protein  34.66 
 
 
212 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.647904  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2299  cation efflux protein  38.07 
 
 
211 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000556065  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3386  cation efflux protein  38.07 
 
 
211 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159873  normal  0.0711306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3481  cation efflux protein  34.41 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1371  cation efflux protein  34.38 
 
 
206 aa  96.7  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2301  cation efflux protein  30.94 
 
 
218 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.827843  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2560  hypothetical protein  36.63 
 
 
214 aa  93.2  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2930  cation efflux protein  33.89 
 
 
216 aa  92.8  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1666  cation efflux protein  35.06 
 
 
219 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3109  cation efflux protein  37.2 
 
 
213 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278802  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2444  cation efflux protein  37.25 
 
 
245 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1521  hypothetical protein  33.91 
 
 
204 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  0.204362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3409  cation efflux protein  34.76 
 
 
236 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0994  Co/Zn/Cd efflux system component  39.13 
 
 
207 aa  85.9  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425343  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2157  cation efflux protein  34.42 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000839381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1788  cation efflux protein  32.45 
 
 
203 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5042  cation efflux protein  36.36 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4511  cation efflux protein  30.95 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5509  cation efflux protein  32.28 
 
 
199 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3643  cation efflux protein  34.55 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0262252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2056  cation efflux protein  29.94 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0243028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
939 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4140  putative transporter  32.68 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  25.29 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  24.62 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0679  transporter  34.23 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0893  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  45.35 
 
 
106 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1827  cation efflux protein  29.68 
 
 
199 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0504  cation efflux protein  30.06 
 
 
201 aa  62.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2073  cation efflux protein  31.58 
 
 
207 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279262  normal  0.0942444 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  25.91 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  25.15 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  25.15 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 
799 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 
712 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  59.09 
 
 
972 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 
984 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>