More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3130 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 404 aa  849    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  60.66 
 
 		 399 aa  530  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  62.27 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  60.35 
 
 		 410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  59.89 
 
 		 379 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  58.91 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  58.66 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  56.97 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  54.47 
 
 		 387 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  52.77 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  54.47 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  53.58 
 
 		 387 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  48.98 
 
 		 404 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  47.96 
 
 		 407 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  45.38 
 
 		 391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  42.12 
 
 		 399 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  43.1 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 		 394 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  43.47 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  42.35 
 
 		 394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  43.63 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  42.42 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  40.98 
 
 		 394 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  43.59 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  42.82 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  42.37 
 
 		 382 aa  305  9.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  41.48 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.89 
 
 		 394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  40.11 
 
 		 393 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  41.58 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 		 393 aa  298  8e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  42.6 
 
 		 422 aa  297  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  42.36 
 
 		 399 aa  295  8e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  42.28 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 397 aa  292  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  40.05 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  38.07 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  38.94 
 
 		 407 aa  286  5.999999999999999e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  37.37 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  36.56 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  35.97 
 
 		 401 aa  254  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  37.77 
 
 		 415 aa  253  6e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 		 391 aa  243  6e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  37.11 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 342 aa  206  8e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  35.03 
 
 		 377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  34.07 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 		 378 aa  186  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 		 496 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30.45 
 
 		 363 aa  176  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.81 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2082  radical SAM family protein  32.09 
 
 		 321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.460163 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  32.13 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  29.41 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30 
 
 		 349 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 		 414 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  30.17 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  30.71 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 354 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  29.13 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  32.76 
 
 		 769 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 356 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 399 aa  152  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.81 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  30.75 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  28.65 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 		 361 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.94 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.61 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  31.05 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  29.4 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  28.61 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>