More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3047 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  73.47 
 
 		 256 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  69.05 
 
 		 252 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  65.86 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2101  ABC transporter related  69.05 
 
 		 252 aa  325  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.250257 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  63.67 
 
 		 245 aa  325  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  63.41 
 
 		 244 aa  325  5e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  62.75 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.86 
 
 		 245 aa  322  5e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  62.7 
 
 		 263 aa  321  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  64.85 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  62.75 
 
 		 247 aa  319  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  63.52 
 
 		 249 aa  318  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.27 
 
 		 257 aa  318  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  61.89 
 
 		 258 aa  317  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  61.22 
 
 		 247 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  61.89 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  59.59 
 
 		 251 aa  313  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  62.24 
 
 		 259 aa  313  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  64.44 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  61.73 
 
 		 265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.41 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  60.41 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  63.11 
 
 		 244 aa  311  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  59.02 
 
 		 255 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  63.6 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  60 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.55 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  62.81 
 
 		 273 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  59.92 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  60.41 
 
 		 270 aa  310  1e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  61.32 
 
 		 247 aa  309  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  60.82 
 
 		 258 aa  309  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  59.18 
 
 		 246 aa  310  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  61.22 
 
 		 257 aa  310  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  61.22 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  61.63 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  60.82 
 
 		 267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61.13 
 
 		 247 aa  308  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.52 
 
 		 249 aa  308  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  60.41 
 
 		 251 aa  308  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  60 
 
 		 254 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  60.32 
 
 		 251 aa  308  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  58.78 
 
 		 262 aa  308  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  61.04 
 
 		 245 aa  308  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  60 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  61.63 
 
 		 246 aa  307  8e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  60.82 
 
 		 246 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.78 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  59.11 
 
 		 255 aa  305  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60.91 
 
 		 239 aa  306  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  63.18 
 
 		 240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  60.08 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  59.67 
 
 		 242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  58.78 
 
 		 259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  61.32 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  61.98 
 
 		 273 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61.73 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  58.3 
 
 		 253 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  60.82 
 
 		 242 aa  304  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  59.84 
 
 		 261 aa  304  9.000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  59.51 
 
 		 261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.92 
 
 		 256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  62.03 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  59.18 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  59.18 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  60.08 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.43 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  59.84 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.43 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 269 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  58.61 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  60.32 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 		 251 aa  301  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  57.96 
 
 		 256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  59.92 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59.09 
 
 		 269 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  60.57 
 
 		 252 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  59.67 
 
 		 245 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  62.14 
 
 		 247 aa  301  5.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  59.18 
 
 		 248 aa  301  7.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  58.37 
 
 		 259 aa  301  7.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  59.76 
 
 		 247 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  59.67 
 
 		 246 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  59.67 
 
 		 246 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  62.04 
 
 		 257 aa  301  9e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  59.92 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  60.25 
 
 		 266 aa  300  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  59.26 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  59.92 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 249 aa  298  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  58.68 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  57.96 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  58.68 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60.91 
 
 		 246 aa  298  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  59.67 
 
 		 267 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  59.02 
 
 		 257 aa  298  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>