More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2934 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  648    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  39.1 
 
 		 293 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  38.49 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.61 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  37.31 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.74 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 289 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  34.97 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 346 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  32.45 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 251 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 678 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  30.2 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  30.2 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  32.57 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  28.94 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  25.57 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 277 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 294 aa  86.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  29.74 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  26.15 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 515 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2863  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2788  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1060  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0590  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.988044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1156  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2849  AraC family transcription regulator  39.56 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1738  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1774  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0699  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2729  AraC family transcription regulator  39.56 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2428  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1057  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0171524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2126  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330362  normal  0.517633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1178  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  28.37 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>