62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2911 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  100 
 
 
621 aa  1291    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  40.79 
 
 
616 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  28.64 
 
 
622 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  29.66 
 
 
616 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  31.28 
 
 
650 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  28.81 
 
 
616 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  30.9 
 
 
619 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  28.66 
 
 
617 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  28.57 
 
 
648 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  29.39 
 
 
646 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  31.32 
 
 
668 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  30.72 
 
 
659 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  30.14 
 
 
670 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  28.62 
 
 
632 aa  179  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  29.49 
 
 
671 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  29.66 
 
 
639 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  26.6 
 
 
655 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  28.66 
 
 
714 aa  166  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  28.16 
 
 
649 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  29.46 
 
 
648 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  26.96 
 
 
661 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  27.8 
 
 
628 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  27.76 
 
 
628 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  28.47 
 
 
623 aa  160  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  27.68 
 
 
633 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  29.67 
 
 
628 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  27.6 
 
 
626 aa  157  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  28.02 
 
 
616 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  27.74 
 
 
708 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  27.84 
 
 
616 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  29.21 
 
 
678 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  28.2 
 
 
615 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  28.44 
 
 
577 aa  152  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  30.25 
 
 
615 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  29.53 
 
 
706 aa  146  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  34.81 
 
 
477 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03641  peptide methionine sulfoxide reductase  36.54 
 
 
370 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  26.65 
 
 
773 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  25.21 
 
 
777 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  26.57 
 
 
566 aa  72  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3791  hypothetical protein  28.35 
 
 
540 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1409  hypothetical protein  26.9 
 
 
531 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0149  hypothetical protein  25.66 
 
 
561 aa  64.7  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2815  hypothetical protein  25.52 
 
 
552 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152436  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0227  hypothetical protein  24.06 
 
 
534 aa  62.4  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2946  hypothetical protein  26.85 
 
 
550 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288376  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5691  hypothetical protein  23.88 
 
 
548 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1890  hypothetical protein  23.72 
 
 
535 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1184  hypothetical protein  25.24 
 
 
590 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794398  hitchhiker  0.00359059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0682  hypothetical protein  45 
 
 
546 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0755064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2527  hypothetical protein  25.46 
 
 
540 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  22.9 
 
 
520 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2209  hypothetical protein  23.53 
 
 
569 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2198  hypothetical protein  23.53 
 
 
569 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2255  hypothetical protein  23.53 
 
 
569 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1294  hypothetical protein  25 
 
 
577 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450689  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2747  hypothetical protein  25.62 
 
 
542 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2427  hypothetical protein  31.53 
 
 
636 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511382  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03640  hypothetical protein  26.34 
 
 
233 aa  51.6  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4021  hypothetical protein  22.22 
 
 
559 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3435  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  24.76 
 
 
475 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45907  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2674  hypothetical protein  32.97 
 
 
565 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>