159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2894 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
560 aa  1137    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  44.36 
 
 
563 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.95 
 
 
559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  42.86 
 
 
598 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.05 
 
 
565 aa  358  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.98 
 
 
560 aa  348  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.41 
 
 
560 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.9 
 
 
560 aa  329  9e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  36.31 
 
 
571 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  40.57 
 
 
546 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.02 
 
 
560 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.37 
 
 
563 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.05 
 
 
566 aa  319  7.999999999999999e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.14 
 
 
549 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.14 
 
 
547 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
549 aa  301  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  35.93 
 
 
563 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.13 
 
 
526 aa  294  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  34.07 
 
 
530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  35.61 
 
 
546 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.61 
 
 
546 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.77 
 
 
544 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.98 
 
 
556 aa  273  9e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  32.93 
 
 
558 aa  269  8.999999999999999e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  30.47 
 
 
568 aa  266  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  34.22 
 
 
536 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
549 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  35.16 
 
 
537 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.58 
 
 
498 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.03 
 
 
399 aa  260  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.5 
 
 
458 aa  259  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  34.46 
 
 
554 aa  258  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  32.07 
 
 
564 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.59 
 
 
599 aa  256  9e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  37.06 
 
 
563 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  32.95 
 
 
616 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  33.59 
 
 
606 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.2 
 
 
531 aa  249  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.69 
 
 
540 aa  249  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  33.01 
 
 
615 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  32.66 
 
 
607 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.88 
 
 
672 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  32.82 
 
 
615 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  32.82 
 
 
615 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  32.5 
 
 
615 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.5 
 
 
615 aa  247  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  32.5 
 
 
615 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  32.5 
 
 
615 aa  247  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  32.57 
 
 
615 aa  247  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  32.5 
 
 
615 aa  247  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  32.57 
 
 
615 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  32.57 
 
 
611 aa  246  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  34.8 
 
 
557 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.87 
 
 
629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.03 
 
 
542 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  39.84 
 
 
502 aa  243  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  32.38 
 
 
615 aa  243  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.78 
 
 
465 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.87 
 
 
539 aa  242  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  30.64 
 
 
618 aa  242  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  34.52 
 
 
576 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  30.64 
 
 
618 aa  242  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.54 
 
 
624 aa  240  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  38.86 
 
 
419 aa  240  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.8 
 
 
558 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.08 
 
 
558 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.3 
 
 
472 aa  238  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  33.94 
 
 
575 aa  237  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  30.86 
 
 
596 aa  236  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.2 
 
 
625 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  30.93 
 
 
811 aa  234  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.34 
 
 
521 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  34.5 
 
 
540 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.07 
 
 
521 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.71 
 
 
461 aa  233  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.9 
 
 
443 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.34 
 
 
521 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 
451 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.86 
 
 
506 aa  233  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  36.44 
 
 
524 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.8 
 
 
775 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  31.95 
 
 
661 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.79 
 
 
484 aa  229  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  37 
 
 
512 aa  229  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.28 
 
 
668 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  36.31 
 
 
410 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  31.23 
 
 
572 aa  227  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  31.86 
 
 
656 aa  228  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.35 
 
 
473 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.31 
 
 
525 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.78 
 
 
433 aa  227  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.97 
 
 
540 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.27 
 
 
516 aa  225  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  36.57 
 
 
513 aa  225  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.02 
 
 
433 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 
433 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  30.09 
 
 
613 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.28 
 
 
525 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  30.82 
 
 
631 aa  223  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  31.05 
 
 
513 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>