More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2846 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
330 aa  671  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  47.56 
 
 
329 aa  329  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  45.92 
 
 
324 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
332 aa  268  9e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  2.78765e-05 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
348 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  37.54 
 
 
347 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.58985e-06 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  38.23 
 
 
325 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  37.84 
 
 
347 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  37.54 
 
 
347 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 
335 aa  222  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 
334 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 
337 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  37.24 
 
 
331 aa  216  3e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  35.98 
 
 
334 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  36.53 
 
 
335 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  37.08 
 
 
331 aa  215  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 
334 aa  214  2e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 
336 aa  213  4e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  35.06 
 
 
335 aa  212  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  36.59 
 
 
334 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 
332 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 
306 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  35.22 
 
 
340 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  37.58 
 
 
351 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  33.04 
 
 
324 aa  202  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
326 aa  200  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.6714e-05 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  36.45 
 
 
345 aa  199  4e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  35.15 
 
 
360 aa  197  2e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 
326 aa  197  2e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  36.31 
 
 
336 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
299 aa  196  4e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  35.8 
 
 
347 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  34.85 
 
 
330 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.63 
 
 
325 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  31.12 
 
 
321 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.85 
 
 
326 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  38.92 
 
 
341 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 
332 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.77 
 
 
327 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  33.43 
 
 
361 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 
324 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  9.34033e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  36.2 
 
 
337 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 
333 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  33.04 
 
 
336 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.72 
 
 
327 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 
326 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 
332 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  34.66 
 
 
320 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  42.29 
 
 
323 aa  180  3e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  37.13 
 
 
319 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
322 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 
326 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
342 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
285 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 
344 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  34.93 
 
 
327 aa  175  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  35.35 
 
 
331 aa  175  1e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  34.89 
 
 
326 aa  174  1e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 
339 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 
343 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 
336 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 
328 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.63 
 
 
293 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 
322 aa  166  3e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.69 
 
 
323 aa  167  3e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  36.64 
 
 
322 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.21 
 
 
324 aa  165  1e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 
338 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  38.21 
 
 
314 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 
320 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  40.09 
 
 
330 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 
344 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  29.66 
 
 
330 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 
330 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  30.91 
 
 
329 aa  154  3e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  30.98 
 
 
319 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  32.92 
 
 
350 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 
329 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
321 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 
334 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 
338 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 
328 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 
362 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.42 
 
 
338 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  31.14 
 
 
345 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.14 
 
 
344 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.14 
 
 
344 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
351 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 
344 aa  148  1e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
344 aa  148  1e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 
344 aa  147  2e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 
344 aa  147  2e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 
344 aa  147  2e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 
341 aa  147  2e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 
344 aa  147  2e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 
338 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 
323 aa  147  4e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  31.91 
 
 
319 aa  146  4e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 
336 aa  146  4e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 
319 aa  145  8e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>