More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2793 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
588 aa  1165    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  51.36 
 
 
589 aa  589  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  47.12 
 
 
588 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  46.26 
 
 
589 aa  511  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  47.28 
 
 
588 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  47.62 
 
 
588 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  44.31 
 
 
588 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  44.88 
 
 
587 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  40.17 
 
 
591 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  40.14 
 
 
583 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  40.11 
 
 
634 aa  379  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  38.51 
 
 
592 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  37.12 
 
 
622 aa  360  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  39.66 
 
 
591 aa  357  5e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  35.55 
 
 
602 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  35.38 
 
 
596 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  35.69 
 
 
597 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  37.48 
 
 
572 aa  327  4.0000000000000003e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  36.16 
 
 
593 aa  325  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  36.47 
 
 
596 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  33.45 
 
 
596 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  33.56 
 
 
596 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  34.13 
 
 
588 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  33.84 
 
 
575 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  35.8 
 
 
574 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 
575 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  33.56 
 
 
609 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  34.94 
 
 
588 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  33.9 
 
 
601 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  33.73 
 
 
575 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  33.8 
 
 
623 aa  296  9e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.21 
 
 
605 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  36.76 
 
 
599 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  34.86 
 
 
592 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  32 
 
 
605 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 
574 aa  292  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  32.67 
 
 
605 aa  292  1e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  35.15 
 
 
574 aa  292  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  34.18 
 
 
574 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  34.14 
 
 
592 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  33.61 
 
 
592 aa  290  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  33.61 
 
 
592 aa  289  9e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  35.83 
 
 
583 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  34.27 
 
 
574 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  32.99 
 
 
575 aa  287  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  34.17 
 
 
598 aa  287  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  33.67 
 
 
622 aa  287  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  34.11 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  31.45 
 
 
602 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  32.88 
 
 
574 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  32.13 
 
 
608 aa  283  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  33.73 
 
 
575 aa  282  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  33.71 
 
 
616 aa  282  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  33.16 
 
 
575 aa  281  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  33.93 
 
 
613 aa  281  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  31.11 
 
 
602 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  32.72 
 
 
575 aa  280  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  34.27 
 
 
574 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  34.27 
 
 
574 aa  280  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  33.16 
 
 
624 aa  279  9e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  36.01 
 
 
592 aa  279  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  35.8 
 
 
596 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  31.54 
 
 
602 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  34.03 
 
 
574 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  34.09 
 
 
574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 
574 aa  272  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  32.7 
 
 
575 aa  272  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 
574 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  31.81 
 
 
574 aa  269  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  34.21 
 
 
574 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.59 
 
 
606 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  33.45 
 
 
607 aa  267  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  34.29 
 
 
627 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  32.24 
 
 
602 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  35.32 
 
 
579 aa  263  6e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.26 
 
 
609 aa  261  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.46 
 
 
618 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  34.99 
 
 
599 aa  259  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.6 
 
 
612 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  31.38 
 
 
588 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  32.63 
 
 
619 aa  256  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
592 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  33.27 
 
 
592 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  33.27 
 
 
592 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  32.16 
 
 
593 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  30.86 
 
 
605 aa  249  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  31.02 
 
 
614 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  29.91 
 
 
594 aa  240  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  28.34 
 
 
610 aa  232  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.2 
 
 
611 aa  230  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  31.24 
 
 
610 aa  229  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  36.29 
 
 
578 aa  229  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  29.77 
 
 
610 aa  229  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  29.5 
 
 
610 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  30.85 
 
 
618 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  30.1 
 
 
641 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  29.5 
 
 
630 aa  228  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  29.24 
 
 
609 aa  226  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.33 
 
 
610 aa  226  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.89 
 
 
609 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>