297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2757 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  100 
 
 
242 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  39.19 
 
 
246 aa  148  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  40.91 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  42.42 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  39.23 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  38.74 
 
 
262 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  39.37 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.29 
 
 
246 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  39.05 
 
 
244 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  39.73 
 
 
230 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  41.56 
 
 
241 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
239 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  37.39 
 
 
245 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  40.83 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  33.06 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  40 
 
 
238 aa  131  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
247 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  38.57 
 
 
240 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  37.5 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  36.4 
 
 
230 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.94 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  37.84 
 
 
243 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  36.07 
 
 
233 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  32.89 
 
 
232 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  34.78 
 
 
233 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  34.67 
 
 
243 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  33.91 
 
 
233 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
229 aa  121  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  36.82 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  36.82 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  31.51 
 
 
227 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.46 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  35.43 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  32.27 
 
 
204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  34.09 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  37.22 
 
 
241 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  36.16 
 
 
185 aa  118  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  34.88 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
180 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  34.09 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  33.49 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  29.6 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  36.65 
 
 
238 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  33.95 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  37.39 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  33.93 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  33.78 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  30.14 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  32.48 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  30.14 
 
 
234 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  35.27 
 
 
268 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  35.71 
 
 
240 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  35.27 
 
 
268 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  32.31 
 
 
227 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.19 
 
 
238 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
242 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  34.84 
 
 
252 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  34.31 
 
 
255 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  34.06 
 
 
238 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  35.87 
 
 
262 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 
227 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  35.14 
 
 
235 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 
271 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  34.67 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  32.89 
 
 
227 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  32.89 
 
 
227 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  32.89 
 
 
227 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  32.89 
 
 
227 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  33.48 
 
 
227 aa  99  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  33.73 
 
 
279 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  32.89 
 
 
274 aa  98.6  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  32.39 
 
 
293 aa  98.6  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  32.44 
 
 
227 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  32.44 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  34.96 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  32.43 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  31.7 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  35.12 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  29.23 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  32.43 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  33.94 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  33.67 
 
 
268 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  34.22 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  30.4 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  33.63 
 
 
266 aa  95.5  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 
271 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  31.98 
 
 
227 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  31.98 
 
 
227 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  32.44 
 
 
227 aa  95.1  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  33.63 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  33.63 
 
 
254 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  34.08 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  29.15 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>