More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2754 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 
272 aa  559  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  38.93 
 
 
265 aa  162  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  40.08 
 
 
267 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  40.45 
 
 
274 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  33.7 
 
 
309 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  37.34 
 
 
269 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  36.4 
 
 
253 aa  143  4e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  40.93 
 
 
275 aa  142  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  38.43 
 
 
272 aa  141  1e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  36.65 
 
 
269 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  36.53 
 
 
279 aa  138  9e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  39.55 
 
 
274 aa  138  9e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  38.56 
 
 
255 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  38.39 
 
 
268 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  39.05 
 
 
268 aa  137  3e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  35.29 
 
 
292 aa  135  7e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  37.45 
 
 
276 aa  134  1e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  35.29 
 
 
292 aa  135  1e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  8.94072e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  37.39 
 
 
272 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  39.34 
 
 
312 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  37.45 
 
 
272 aa  133  4e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  37.24 
 
 
251 aa  131  1e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.10618e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 
268 aa  131  1e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  39.74 
 
 
267 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  35.27 
 
 
291 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  36.97 
 
 
253 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.3017e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  36.71 
 
 
251 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.03036e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  36.71 
 
 
251 aa  125  8e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.58566e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  36.32 
 
 
253 aa  125  8e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  36.25 
 
 
260 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  36.13 
 
 
251 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.19753e-06  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  36.71 
 
 
251 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.34794e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  36.71 
 
 
251 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.07707e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  36.71 
 
 
251 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.40427e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  36.71 
 
 
251 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  8.73779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  36.71 
 
 
251 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.76262e-06  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  33.46 
 
 
309 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  35.69 
 
 
295 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
267 aa  121  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  35.32 
 
 
295 aa  120  2e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  33.07 
 
 
295 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
270 aa  117  2e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
291 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  37.82 
 
 
251 aa  116  4e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  36.49 
 
 
267 aa  115  7e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  36.49 
 
 
267 aa  115  9e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  37.39 
 
 
251 aa  114  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.89171e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  36.49 
 
 
267 aa  115  1e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  34.75 
 
 
251 aa  114  1e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  32.52 
 
 
558 aa  114  1e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  37.04 
 
 
251 aa  114  2e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
216 aa  114  2e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  31.37 
 
 
307 aa  114  2e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  35.54 
 
 
284 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  38.91 
 
 
294 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  37.39 
 
 
251 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  35.54 
 
 
284 aa  113  4e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  30.74 
 
 
281 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  36.97 
 
 
251 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  30.74 
 
 
281 aa  112  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  34.71 
 
 
290 aa  109  4e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  37.1 
 
 
294 aa  108  7e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  31.22 
 
 
275 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
271 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  32.5 
 
 
262 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  30.86 
 
 
291 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  31.33 
 
 
338 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
321 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  32.16 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  27.98 
 
 
315 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  28.28 
 
 
269 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  30.86 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  33.17 
 
 
306 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  30.45 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  29.76 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  33.93 
 
 
338 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  33.93 
 
 
338 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  32.14 
 
 
338 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  33.93 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  33.93 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  33.93 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  33.93 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
267 aa  89  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.61 
 
 
321 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  28.72 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  30 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  26.53 
 
 
269 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  25.76 
 
 
285 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.37 
 
 
205 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  26.32 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  26.32 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  26.32 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  32.92 
 
 
321 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  26.32 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  26.32 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  32.92 
 
 
321 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  34.76 
 
 
313 aa  85.1  1e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
252 aa  85.5  1e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>