More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2737 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2737  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  100 
 
 
244 aa  514  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3496  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  48.46 
 
 
234 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329165 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2003  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  47.56 
 
 
224 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4975  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.15 
 
 
235 aa  221  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0332  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.67 
 
 
231 aa  221  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0262  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  45.49 
 
 
241 aa  219  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.132081  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0088  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.3 
 
 
229 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001865  tRNA (Guanosine18-2'-O-)-methyltransferase  46.7 
 
 
227 aa  214  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3881  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.35 
 
 
228 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4212  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.4 
 
 
230 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.75 
 
 
230 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.545722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4495  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.85 
 
 
230 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3501  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  44.77 
 
 
234 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00626  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  44.74 
 
 
227 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0536  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.17 
 
 
220 aa  209  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.0365793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4148  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.75 
 
 
230 aa  208  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4870  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  48.2 
 
 
231 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.85 
 
 
229 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.85 
 
 
229 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339816  normal  0.0254174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4069  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.85 
 
 
229 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3960  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.85 
 
 
229 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4130  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.85 
 
 
229 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4585  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  44 
 
 
231 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0102229  unclonable  0.0000000288798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03508  tRNA (Guanosine-2'-O-)-methyltransferase  47.3 
 
 
229 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0054  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.3 
 
 
229 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.3 
 
 
229 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0060  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.3 
 
 
229 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03460  hypothetical protein  47.3 
 
 
229 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3862  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.3 
 
 
229 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4154  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.3 
 
 
229 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3986  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  47.3 
 
 
229 aa  204  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0038  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.85 
 
 
230 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0042  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.85 
 
 
230 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0351  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  44.44 
 
 
250 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4102  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.85 
 
 
229 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2942  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  43.56 
 
 
233 aa  201  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3115  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  43.56 
 
 
233 aa  201  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00157  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  44.98 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0197  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  48.76 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4179  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  46.45 
 
 
219 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0074  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  45.78 
 
 
228 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2234  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  46.76 
 
 
216 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0929  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  43.98 
 
 
216 aa  188  7e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1756  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.85 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1213  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  43.96 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1255  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  43.06 
 
 
219 aa  179  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.87838  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0802  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  43.12 
 
 
229 aa  176  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.681579  hitchhiker  0.00885649 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.97 
 
 
229 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04781  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.53 
 
 
229 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.4365  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1198  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  42.64 
 
 
224 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1577  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  41.28 
 
 
229 aa  168  9e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0817  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  39.13 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.35 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0125765  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04831  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.27 
 
 
224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1727  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40.61 
 
 
212 aa  162  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04421  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.35 
 
 
223 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.961343  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0418  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.68 
 
 
223 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0906  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  42.41 
 
 
196 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000238079  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20701  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.35 
 
 
229 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0312  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40.93 
 
 
212 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2876  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  38.74 
 
 
201 aa  148  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0597  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  40.53 
 
 
250 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00512531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1484  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.36 
 
 
196 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000054837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1972  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.21 
 
 
197 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0293079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2170  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  38.73 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3141  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  39.78 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11883  spoU protein (spoU)  32.47 
 
 
238 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3524  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.71 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.75 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3388  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.44 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4434  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.79 
 
 
231 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18455  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2638  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.34 
 
 
259 aa  99.4  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5009  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.26 
 
 
220 aa  99.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.93 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.282082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2249  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.63 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1528  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.78 
 
 
220 aa  95.1  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.16942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4179  tRNA/rRNA methyltransferase, SpoU  30.43 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0240712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4332  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.76 
 
 
225 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4310  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.36 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0053  tRNA/rRNA methyltransferase  27.09 
 
 
218 aa  88.6  9e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5165  predicted protein  31.29 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0398587 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_5166  predicted protein  31.29 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000100906  normal  0.0342071 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0111  RNA methyltransferase  30.41 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf131  SpoU class tRNA/rRNA methyltransferase  29.41 
 
 
229 aa  87  2e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.06 
 
 
237 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.76 
 
 
276 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2661  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0784  RNA methyltransferase  32.67 
 
 
180 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  29.59 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  29.59 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0139  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl088  rRNA methylase  29.17 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0306  TrmH family tRNA methyltransferase  36.18 
 
 
268 aa  82  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  34 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1765  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.25 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.560778  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0728  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.48 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  31.82 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2051  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.12 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154178  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.81 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>