More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2687 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
784 aa  1596  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
835 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 
1118 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.64 
 
 
1014 aa  358  2e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 
921 aa  357  4e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
916 aa  356  8e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.52 
 
 
1442 aa  356  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
816 aa  353  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 
876 aa  352  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
1363 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
977 aa  351  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  38.09 
 
 
1346 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
812 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38.96 
 
 
1177 aa  346  7e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 
1397 aa  343  5e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
1550 aa  343  6e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
1398 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
929 aa  341  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
1202 aa  339  1e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
1131 aa  337  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1021 aa  336  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  37.38 
 
 
847 aa  333  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1009 aa  332  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
1072 aa  332  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 
1765 aa  332  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
1768 aa  331  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
1090 aa  331  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.15 
 
 
1763 aa  330  5e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  36.35 
 
 
1322 aa  330  6e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
1767 aa  329  1e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
946 aa  327  4e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1433 aa  327  4e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.59 
 
 
923 aa  327  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 
985 aa  327  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
1284 aa  326  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.02 
 
 
1499 aa  325  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
1771 aa  324  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
1767 aa  325  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
1767 aa  324  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  37.06 
 
 
977 aa  323  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1126 aa  323  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
1240 aa  323  9e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
833 aa  321  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.62 
 
 
1765 aa  320  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
705 aa  320  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
1069 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
758 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  33.58 
 
 
1574 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  31.94 
 
 
765 aa  317  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  35.82 
 
 
1135 aa  317  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1258 aa  317  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
916 aa  318  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1040 aa  317  7e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.92 
 
 
852 aa  316  1e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 
1369 aa  315  2e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.16 
 
 
2213 aa  314  4e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.26448e-07 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
917 aa  314  4e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
919 aa  314  5e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
818 aa  313  6e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.29 
 
 
1331 aa  313  8e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
917 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
1326 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.81 
 
 
937 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
950 aa  311  3e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 
993 aa  311  3e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
925 aa  310  6e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
920 aa  310  7e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
1784 aa  309  1e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
1782 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  32.86 
 
 
1351 aa  307  4e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1266 aa  308  4e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
818 aa  307  5e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
1245 aa  306  9e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
1792 aa  306  1e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
1033 aa  306  1e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
917 aa  305  3e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  5.92891e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
1786 aa  305  3e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
1064 aa  304  3e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  36.52 
 
 
1030 aa  304  3e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  32.5 
 
 
925 aa  304  5e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  32.47 
 
 
917 aa  303  6e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
770 aa  303  8e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  32.5 
 
 
925 aa  303  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.03 
 
 
2035 aa  303  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 
1240 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
1788 aa  303  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
1340 aa  301  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 
925 aa  300  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
936 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
928 aa  299  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
927 aa  299  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
830 aa  299  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  33.45 
 
 
905 aa  298  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  34.75 
 
 
1407 aa  297  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
964 aa  297  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 
957 aa  296  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.17317e-06 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4408  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:histidine kinase:histidine kinase  32.44 
 
 
929 aa  296  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  36.99 
 
 
761 aa  296  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
1333 aa  296  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02305e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  31.96 
 
 
1683 aa  296  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>