213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2584 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 439 aa  867    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  99.59 
 
 		 1565 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  99.59 
 
 		 1565 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  50.83 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  55.48 
 
 		 450 aa  398  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  47.94 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 472 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  47.25 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  52.7 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  47.15 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  47.15 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  49.05 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  52.49 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  46.7 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  47.81 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  46.74 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  48.76 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  47.29 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  49.65 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  48.37 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  51.82 
 
 		 447 aa  356  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  48.21 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  48.05 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  50.61 
 
 		 444 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  48.8 
 
 		 429 aa  342  5.999999999999999e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 461 aa  342  7e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  49.76 
 
 		 449 aa  342  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 		 462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  48.79 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  40.28 
 
 		 515 aa  309  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  39.83 
 
 		 515 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  40.21 
 
 		 515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  40.82 
 
 		 515 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  40.82 
 
 		 515 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  40.69 
 
 		 516 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  37.68 
 
 		 550 aa  301  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 		 504 aa  299  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 482 aa  299  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 		 482 aa  299  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  40.12 
 
 		 516 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 553 aa  295  8e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  39.96 
 
 		 519 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 443 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 		 447 aa  285  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  40.31 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  41.53 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 443 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 412 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  33.57 
 
 		 424 aa  231  3e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  36.58 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  37.23 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  35.62 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  35.62 
 
 		 429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 454 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  37.19 
 
 		 460 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  35.39 
 
 		 426 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  32.49 
 
 		 450 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 455 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  32.94 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 450 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 416 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  30.97 
 
 		 447 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  32.72 
 
 		 428 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  31.28 
 
 		 462 aa  206  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  34.73 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 444 aa  206  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  33.33 
 
 		 495 aa  203  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  33.33 
 
 		 495 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  32.43 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  32.67 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  30.88 
 
 		 492 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  32.77 
 
 		 489 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  30.65 
 
 		 492 aa  193  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  30.65 
 
 		 492 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1309  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 475 aa  192  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.327307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  30.38 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>