More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2580 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  60.04 
 
 		 544 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  61.15 
 
 		 585 aa  756    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  58.58 
 
 		 584 aa  726    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  61.39 
 
 		 596 aa  733    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  57.59 
 
 		 586 aa  723    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  59.86 
 
 		 581 aa  707    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  58.81 
 
 		 591 aa  705    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 578 aa  1206    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 578 aa  1206    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 578 aa  1206    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  50.43 
 
 		 587 aa  597  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  46.54 
 
 		 577 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  42.53 
 
 		 589 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  46.93 
 
 		 598 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  41.61 
 
 		 568 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  43.13 
 
 		 559 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  42.72 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  42.72 
 
 		 559 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  42.72 
 
 		 559 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  42.72 
 
 		 559 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  42.72 
 
 		 559 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  41.99 
 
 		 556 aa  430  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  41.48 
 
 		 555 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  42.41 
 
 		 561 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  41.32 
 
 		 565 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  36.76 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  37.67 
 
 		 586 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 586 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 		 589 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  38.09 
 
 		 575 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  36.16 
 
 		 583 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  36.72 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  35.54 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  38.65 
 
 		 575 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  29.89 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 491 aa  180  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  29.04 
 
 		 492 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  29.04 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  29.07 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  28.82 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  27.31 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  27.47 
 
 		 493 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  28.05 
 
 		 498 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  26.7 
 
 		 644 aa  164  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  27.59 
 
 		 482 aa  164  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  28.1 
 
 		 494 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  28.32 
 
 		 494 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  28.45 
 
 		 483 aa  160  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  28.1 
 
 		 494 aa  160  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 663 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  27.61 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  26.41 
 
 		 485 aa  157  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  26.52 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  27.5 
 
 		 651 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  25.62 
 
 		 645 aa  154  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  25.75 
 
 		 650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  24.53 
 
 		 650 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  24.59 
 
 		 534 aa  144  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  25.22 
 
 		 650 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  26.56 
 
 		 667 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  24.67 
 
 		 548 aa  141  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  29.5 
 
 		 672 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  24.77 
 
 		 1102 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  24.77 
 
 		 1102 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  25.2 
 
 		 652 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  26.76 
 
 		 638 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  24.73 
 
 		 1102 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  25.62 
 
 		 649 aa  135  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  24.21 
 
 		 1092 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  24.63 
 
 		 1088 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  24.64 
 
 		 551 aa  134  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  24.26 
 
 		 1100 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  24.08 
 
 		 1100 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  23.66 
 
 		 1110 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  26.12 
 
 		 643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  26.2 
 
 		 651 aa  131  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  23.79 
 
 		 1152 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  23.78 
 
 		 1088 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  23.79 
 
 		 1154 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  26.42 
 
 		 638 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  22.99 
 
 		 1088 aa  128  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  22.93 
 
 		 1094 aa  128  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  23.21 
 
 		 1154 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  22.34 
 
 		 1101 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  23.69 
 
 		 1088 aa  127  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  23.69 
 
 		 1088 aa  127  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  23.85 
 
 		 553 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  25.47 
 
 		 641 aa  127  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  25.1 
 
 		 646 aa  126  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  23.84 
 
 		 1061 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  26.14 
 
 		 642 aa  126  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  22.1 
 
 		 1085 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  23.41 
 
 		 1164 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  23.41 
 
 		 1164 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  29.8 
 
 		 556 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  27.85 
 
 		 1100 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  22.72 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  24.35 
 
 		 657 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  23.19 
 
 		 1099 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  24 
 
 		 1114 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>