More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2577 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  38.29 
 
 		 1572 aa  853    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  37.09 
 
 		 1586 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  37.44 
 
 		 1595 aa  819    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  39.33 
 
 		 1576 aa  897    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  39.1 
 
 		 1614 aa  879    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  99.92 
 
 		 1611 aa  2734    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1565 aa  3237    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1565 aa  3237    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  99.59 
 
 		 439 aa  502  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1527 aa  312  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  28.6 
 
 		 1520 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  28.6 
 
 		 1550 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1551 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1547 aa  305  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  28.56 
 
 		 1586 aa  302  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1197 aa  285  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.28 
 
 		 1485 aa  280  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.82 
 
 		 1429 aa  275  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  27.73 
 
 		 1560 aa  273  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.69 
 
 		 1508 aa  265  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  27.77 
 
 		 1554 aa  264  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.73 
 
 		 1509 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  27.07 
 
 		 1384 aa  260  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  29.84 
 
 		 1494 aa  257  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  29.84 
 
 		 1494 aa  257  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.68 
 
 		 1602 aa  254  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  27.4 
 
 		 1528 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.77 
 
 		 1488 aa  253  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.51 
 
 		 1609 aa  253  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.6 
 
 		 1568 aa  252  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  27.54 
 
 		 1421 aa  250  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.76 
 
 		 1446 aa  248  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.79 
 
 		 1626 aa  248  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.62 
 
 		 1348 aa  248  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.39 
 
 		 1579 aa  243  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.34 
 
 		 1428 aa  242  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  29.05 
 
 		 1487 aa  242  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.78 
 
 		 1518 aa  242  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.81 
 
 		 1573 aa  241  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1494 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1410 aa  241  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1620 aa  240  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.9 
 
 		 1528 aa  239  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.34 
 
 		 1489 aa  238  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  28.04 
 
 		 1359 aa  238  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  27.08 
 
 		 1530 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.27 
 
 		 1362 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 466 aa  232  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1552 aa  232  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.67 
 
 		 1543 aa  231  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1583 aa  231  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1411 aa  230  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.41 
 
 		 1259 aa  229  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  46.24 
 
 		 450 aa  229  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  50.99 
 
 		 475 aa  229  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  46.01 
 
 		 417 aa  228  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1531 aa  227  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  54.31 
 
 		 415 aa  227  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.77 
 
 		 1385 aa  226  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  29.61 
 
 		 924 aa  225  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1409 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.99 
 
 		 3027 aa  224  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  43.17 
 
 		 466 aa  223  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 465 aa  223  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  27.07 
 
 		 1517 aa  222  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  26.2 
 
 		 1593 aa  221  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1418 aa  221  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1400 aa  221  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1495 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.55 
 
 		 1981 aa  219  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  58.24 
 
 		 462 aa  218  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1229 aa  218  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  49.54 
 
 		 472 aa  218  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1419 aa  217  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  51.4 
 
 		 466 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  26.59 
 
 		 1604 aa  217  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  46.58 
 
 		 478 aa  216  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 472 aa  215  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  45.49 
 
 		 461 aa  215  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25.72 
 
 		 1679 aa  214  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  51.5 
 
 		 475 aa  214  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  56.99 
 
 		 429 aa  214  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  26.56 
 
 		 1673 aa  214  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1390 aa  214  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 463 aa  214  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  24.11 
 
 		 2035 aa  213  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  26.68 
 
 		 1140 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  42.62 
 
 		 462 aa  213  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  48.84 
 
 		 515 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1402 aa  213  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 465 aa  214  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  48.34 
 
 		 515 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 463 aa  213  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  51.3 
 
 		 515 aa  212  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  51.3 
 
 		 515 aa  211  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  48.89 
 
 		 468 aa  212  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  48.34 
 
 		 471 aa  211  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  48.58 
 
 		 471 aa  211  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 		 471 aa  211  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  48.58 
 
 		 471 aa  211  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>